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J-GLOBAL ID：202002259304508782   整理番号：20A1739773

北極のパイオニア植物Oxyria digynaの内生細菌コミュニティにおける組織特異的動力学【JST・京大機械翻訳】

Tissue-Specific Dynamics in the Endophytic Bacterial Communities in Arctic Pioneer Plant Oxyria digyna

著者 (4件)： Given Cindy (Department of Biological and Environmental Science, University of Jyvaeskylae, Jyvaeskylae, Finland) ,  Haeikio Elina (Department of Environmental and Biological Sciences, University of Eastern Finland, Kuopio, Finland) ,  Kumar Manoj (Department of Biological and Environmental Science, University of Jyvaeskylae, Jyvaeskylae, Finland) ,  Nissinen Riitta (Department of Biological and Environmental Science, University of Jyvaeskylae, Jyvaeskylae, Finland)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 11  ページ： 561  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 近年の次世代配列決定法の急速な発展は,内生細菌の群集構造と機能に関する豊富な情報を提供した。しかし,異なる植物組織におけるこれらのコミュニティの組立プロセスは,特に自然設定における野生植物において,まだ十分に理解されていない。本研究の目的は,アルクチアルピン先駆植物Oxyriaジギナの葉と根における内生細菌群落の組成を比較し,植物組織(葉または根)または植物起源が群集集合にどのように影響するかを調べることである。これに取り組むために,著者らは,低北極圏において,自然のO.digyna個体群を有する実験サイトにおいて,低い細菌負荷(bait植物)を有するマイクロプロパゲーションO.digyna植物を植えた。ベイト植物の葉と根における内生細菌群落構造を,圃場で1年の生育期と1年後に分析し,同じ場所で生育する野生植物のそれらと比較した。16S rRNA遺伝子標的配列決定は,根における内生群落が葉より多様であり,ベイト植物の多様性が圃場で増加し,野生植物で最高であることを示した。組織型と植物群は,内生細菌群落構造に強い影響を及ぼした。Firmicutesは,両方の植物タイプの葉群落において非常に豊富であった。ProteobacteriaとBacteroidetesは,異なる植物グループにおける異なる相対豊度にもかかわらず,根においてより豊富であった。ベイト植物における群集構造は,時間とともに圃場で変化し,野生植物内生コミュニティにますます似ていた。これは,いくつかの細菌分類群の相対存在量,および圃場での種獲得の変化によるものであったが,種ターンオーバーはなかった。圃場のベイト植物によって獲得され,リン酸塩可溶化とジアゾ栄養細菌分類群を代表するいくつかのOTUsは,この非菌根植物に対するこれらの細菌の栄養獲得における主要な役割を示唆し,栄養不良北極土壌で生育する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *細菌 ,  可溶化 ,  リン酸塩 ,  遺伝子 ,  植物組織 ,  野生植物 ,  個体群 ,  群落 ,  植物群落 ,  北極圏 ,  成長期
準シソーラス用語： プロテオバクテリア ,  16S rRNA ,  群集構造 ,  Firmicutes , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 内生細菌 ,  Oxyriaジギナ ,  組織特異性 ,  細菌遷移 ,  先駆植物 ,  北極細菌

分類 (3件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  土壌生物  (FB04050N) ,  果樹  (FC03042G)

引用文献 (52件)：

• Abreu-Tarazi M. F., Navarrete A. A., Andreote F. D., Almeida C. V., Tsai S. M., Almeida M. (2010). Endophytic bacteria in long-term in vitro cultivated ‘axenic’ pineapple microplants revealed by PCR-DGGE. World J. Microbiol. Biotechnol. 26 555-560.
• Anderson M. J. (2017). Permutational Multivariate Analysis of Variance (PERMANOVA). Hoboken, NJ: Wiley, 1-15.
• Bai Y., Müller D. B., Srinivas G., Garrido-Oter R., Potthoff E., Rott M., et al (2015). Functional overlap of the Arabidopsis leaf and root microbiota. Nature 528 364-369. doi: 10.1038/nature16192
• Bernardet J.-F., Bowman J. P. (2015). “"Flavobacterium,"” in Bergey’s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria, ed. Whitman W. B. (Hoboken, NJ: Wiley), 1-75. doi: 10.1038/nature16192
• Bertani I., Abbruscato P., Piffanelli P., Subramoni S., Venturi V. (2016). Rice bacterial endophytes: isolation of a collection, identification of beneficial strains and microbiome analysis. Environ. Microbiol. Rep. 8 388-398. doi: 10.1111/1758-2229.12403

タイトルに関連する用語 (6件)： 北極 ,  植物 ,  内生細菌 ,  コミュニティ ,  組織 ,  動力学