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J-GLOBAL ID：202002259374943117   整理番号：20A0653962

DNAメチル化エピゲノム型に基づくHPV関連およびHPV陰性口腔咽頭扁平上皮癌の層別化【JST・京大機械翻訳】

Stratification of HPV-associated and HPV-negative oropharyngeal squamous cell carcinomas based on DNA methylation epigenotypes

著者 (14件)： Nakagawa Takuya (Department of Otorhinolaryngology, Head and Neck Surgery, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Nakagawa Takuya (Department of Molecular Oncology, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Matsusaka Keisuke (Department of Molecular Oncology, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Matsusaka Keisuke (Department of Pathology, Chiba University Hospital, Chiba, Japan) ,  Misawa Kiyoshi (Department of Otolaryngology/Head and Neck Surgery, Hamamatsu University School of Medicine, Hamamatsu, Japan) ,  Ota Satoshi (Department of Pathology, Chiba University Hospital, Chiba, Japan) ,  Fukuyo Masaki (Department of Molecular Oncology, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Rahmutulla Bahityar (Department of Molecular Oncology, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Kunii Naoki (Department of Otorhinolaryngology, Head and Neck Surgery, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Sakurai Daiju (Department of Otorhinolaryngology, Head and Neck Surgery, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Hanazawa Toyoyuki (Department of Otorhinolaryngology, Head and Neck Surgery, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Matsubara Hisahiro (Department of Frontier Surgery, Graduate School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Okamoto Yoshitaka (Department of Otorhinolaryngology, Head and Neck Surgery, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan) ,  Kaneda Atsushi (Department of Molecular Oncology, School of Medicine, Chiba University, Chiba, Japan)
資料名： International Journal of Cancer  (International Journal of Cancer)
巻： 146  号： 9  ページ： 2460-2474  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0267B  ISSN： 0020-7136  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 口腔咽頭扁平上皮癌(OPSCC)の発生率は,これらの20年で増加しているが,主にヒトパピローマウイルス(HPV)により,異なる臨床病理学的特徴を示す分子サブグループへのOPSCCの層別化は,完全には検討されていない。このコホートにおける89例と癌ゲノム地図により報告された81例を含む170例のOPSCC症例に対し,Infinium450Kを用いてDNAメチローム解析を行い,標的化エクソン配列解析を行った。我々は,階層的クラスタリング解析により,OPSCCを階層的クラスタリング解析により階層化した。分類器マーカーのメチル化レベルをピロシーケンスを用いて定量的に検証し,受信者動作特性(ROC)曲線の曲線下面積(AUC)値を計算した。OPSCCは4つのエピタイプに層別化された:HPV(+)高メチル化(OP1),HPV(+)中間メチル化(OP2),HPV(-)中間メチル化(OP3)およびHPV(-)低メチル化(OP4)。10のメチル化マーカー遺伝子を発生させた:5つはHPV(+)症例をOP1とOP2に分類し,5つはHPV(-)症例をOP3とOP4に分類する。ROC曲線のAUC値は,2つのマーカーパネルでそれぞれ0.969と0.952であった。HPV(+)群(p<0.01)よりHPV(-)で有意に高いTP53変異とCCND1コピー数増加が観察されたが,OP1とOP2,またはOP3とOP4の間にゲノム異常の有意差は観察されなかった。4つのエピゲノタイプは,有意に異なる予後(p=0.0006)を示し,一般的に好ましいHPV(+)症例の中で最も好ましいOPSCCサブグループ(OP1)を識別し,一般的に好ましくないHPV(-)症例の中で最も好ましくないOPSCCサブグループ(OP3)を示した。HPV(+)とHPV(-)OPSCCはさらに異なるDNAメチル化エピゲノタイプに分けられ,有意に異なる予後を示す。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  サイクリンD1 ,  コピー数 ,  ターゲティング ,  予後 ,  母集団 ,  *ゲノム ,  *扁平上皮癌 ,  血中濃度-時間曲線下面積 ,  階層構造 ,  *メチル化 ,  *層別
準シソーラス用語： ヒトパピローマウイルス ,  *エピゲノム ,  *DNAメチル化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： DNAメチル化 ,  ヒトパピローマウイルス ,  頭頚部扁平上皮癌

分類 (2件)： 耳・鼻・咽頭・喉頭の腫よう  (GQ04000E) ,  歯と口腔の腫よう  (GT04000N)

タイトルに関連する用語 (6件)： DNAメチル化 ,  エピゲノム ,  HPV ,  口腔咽頭 ,  扁平上皮癌 ,  層別化