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J-GLOBAL ID：202002259606591432   整理番号：20A2442392

示唆されたCOVID-19薬剤と比較したSARS-CoV-2主要標的蛋白質の新規阻害剤としてのイリマキノン(マリンスポンジ代謝産物): 設計,ドッキングおよび分子動力学シミュレーション研究【JST・京大機械翻訳】

Ilimaquinone (marine sponge metabolite) as a novel inhibitor of SARS-CoV-2 key target proteins in comparison with suggested COVID-19 drugs: designing, docking and molecular dynamics simulation study

著者 (9件)： Surti Malvi (Bapalal Vaidya Botanical Research Centre, Department of Biosciences, Veer Narmad South Gujarat University, Surat, 395007, Gujarat, India. [e-mail]) ,  Patel Mitesh ,  Adnan Mohd ,  Moin Afrasim ,  Ashraf Syed Amir ,  Siddiqui Arif Jamal ,  Snoussi Mejdi ,  Deshpande Sumukh ,  Reddy Mandadi Narsimha
資料名： RSC Advances (Web)  (RSC Advances (Web))
巻： 10  号： 62  ページ： 37707-37720  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7055A  ISSN： 2046-2069  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 新規コロナウイルス,SARS-CoV-2の大流行は,36百万人以上の人々に感染し,2020年10月9日に約100万人の死亡を引き起こした。ウイルスの拡大と症例数の急速な上昇は,効果のある薬剤とワクチンの瞬間的な発達を必要とする。現在,感染治療に利用できる承認薬またはワクチンはない。そのようなシナリオにおいて,ウイルス感染に対する好都合な治療アプローチの一つは,無視できる副作用を有する製品を得ることを目的とする計算アプローチを利用して,酵素阻害剤アミドスト天然化合物を探索することである。本研究では,in silico分子相互作用に基づくアプローチを用いて,9つの異なる重要なSARS-CoV-2標的蛋白質(スパイク受容体結合ドメイン,RNA依存性RNAポリメラーゼ,Nsp10,Nsp13,Nsp14,Nsp15,Nsp16,主要プロテアーゼ,およびパパイン様プロテアーゼ)の活性結合ポケットにおけるヒドロキシクロロキン,アジスロマイシン,ファビピラビル,イベルメクチンおよびレムデシビルとの比較において,リマキノン(海洋スポンジ代謝産物)の阻害展望を評価した。さらに,SARS-CoV-2パパイン様プロテアーゼ(PLpro)-リマキノン複合体の分子動力学(MD)シミュレーションも行い,根平均二乗変動(RMSF),二乗平均平方根偏差(RMSD),回転半径(R_g)および水素結合相互作用を含む各種構造パラメータを計算した。PLproは,ウイルス複製における必須の役割および宿主細胞蛋白質からのストリッピングユビキチンおよびインターフェロン刺激遺伝子15(ISG15)の付加的機能により,有望な薬剤標的である。すべての重要なSARS-CoV-2標的蛋白質の可能な阻害の観点から,著者らの研究はin vivoでの深さリマキノン作用における研究の重要性を強調した。Copyright 2020 Royal Society of Chemistry All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水素結合 ,  分子間相互作用 ,  *計算機シミュレーション ,  ウイルス感染 ,  酵素阻害剤 ,  *代謝産物 ,  パパイン ,  副作用 ,  ワクチン ,  結合部位 ,  ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  ウイルス複製 ,  *分子動力学 ,  ユビキチン
準シソーラス用語： in silico ,  *分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (10件)： 薬剤 ,  標的蛋白質 ,  阻害剤 ,  イリマキノン ,  スポンジ ,  代謝産物 ,  設計 ,  ドッキング ,  分子動力学シミュレーション ,  研究