二倍体親からの三倍体子孫の遺伝子型呼び出し【JST・京大機械翻訳】

Grashei Kim Erik; Grashei Kim Erik; Odegard Jorgen; Odegard Jorgen; Meuwissen Theo H. E.

文献

J-GLOBAL ID：202002259617263132 整理番号：20A2755066

二倍体親からの三倍体子孫の遺伝子型呼び出し【JST・京大機械翻訳】

Genotype calling of triploid offspring from diploid parents

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資料名：
巻： 52 号： 1 ページ： 1-15 発行年： 2020年
JST資料番号： U7383A ISSN： 1297-9686 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

多倍数性は動物および特に植物において広く分布している。異なる種類の倍数性,例えば,コムギにおける六倍体,イチゴにおける八倍体,および魚類における二倍体,三倍体,四倍体,および擬四倍体(部分四倍体)が存在する。二倍体親からの三倍体子孫は,タイセイヨウサケ(Salmo salar)の野生で頻繁に発生し,一般に三倍体で,三倍体個体は不稔である。大西洋サケにおける誘発三倍体は,無菌魚を生産するための一般的な実践である。ノルウェー養殖において,不稔三倍体魚類の生産は,野生と養殖魚の間の遺伝子移入を制限するための政府と産業による試みである。しかし,三倍体魚は二倍体のものと異なる形質と性質を有する。三倍体における遺伝的マーカーの遺伝子型呼び出しは標準ソフトウェアによって支持されないので,三倍体における形質の背後にある遺伝学を調査することは挑戦的である。著者らの目的は,三倍体個体における遺伝子マーカーの遺伝子型呼び出しに使用できる方法を開発することであった。56K Thermo Fisher GeneTitan遺伝子タイピングプラットフォームを用いて381の三倍体大西洋サケ子孫に対して対立遺伝子シグナルを作製した。遺伝子型は(形質転換)対立遺伝子信号に有限正常混合モデルを適用することによりうまく呼ばれる。マーカーのサブセットは,下流分析による使用のために品質管理統計によって濾過した。いわゆる遺伝子型の品質は,三倍体子孫への二倍体親の帰属を可能にし,常染色体遺伝パターンから母系と父親の両親を識別するのに十分であった。さらに,三倍体子孫の母性遺伝は雌性発生遺伝と同一であるので,各染色体の母性組換パターンは遺伝子中心体マッピングで使用されるものと同様のアプローチを用いてマッピングできた。著者らは,三倍体個体のための高密度マーカー遺伝子型の呼び出しが実現可能であることを示した。得られた遺伝子型は,二倍体親への三倍体子孫の親子帰属に使用可能であり,常染色体遺伝パターンを用いて母系と父親を区別し,遺伝子中心体マッピングに類似したアプローチを用いて母系組換えパターンをマッピングする。三倍体個体の遺伝子型決定は,選択的育種プログラムおよび三倍体で記録された表現型の根底にある遺伝学の解明に重要である。原理的に,開発した方法は他の倍数体生物の遺伝子型呼び出しに使用できる。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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魚類

引用文献 (34件)：

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Aquaculture; Polyploid fish and shellfish: production, biology and applications to aquaculture for performance improvement and genetic containment; F Piferrer, A Beaumont, JC Falguière, M Flajšhans, P Haffray, L Colombo; 293; 2009; 125-156; 10.1016/j.aquaculture.2009.04.036; citation_id=CR4
Fisher T. GeneTitan multi-channel (MC) instrument. 2018. https://www.thermofisher.com/no/en/home/life-science/microarray-analysis/microarray-analysis-instruments-software-services/microarray-analysis-instruments/genetitan-multi-channel-instrument.html. Accessed 13 Mar 2020.

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