文献

J-GLOBAL ID：202002260179295533   整理番号：20A0189020

制約付き反復ランダムサンプリングを用いた質量分析イメージングにおける判別分析と特徴選択-交差検証(CORRS-CV)【JST・京大機械翻訳】

Discriminant analysis and feature selection in mass spectrometry imaging using constrained repeated random sampling - Cross validation (CORRS-CV)

著者 (4件)： Perez-Guaita David (FOCAS Research Institute, Dublin, Ireland) ,  Quintas Guillermo (Health & Biomedicine, LEITAT Technological Center, Barcelona, Spain) ,  Quintas Guillermo (Unidad Analitica, Health Research Institute Hospital La Fe, Valencia, Spain) ,  Kuligowski Julia (Neonatal Research Unit, Health Research Institute Hospital La Fe, Valencia, Spain)
資料名： Analytica Chimica Acta  (Analytica Chimica Acta)
巻： 1097  ページ： 30-36  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0394A  ISSN： 0003-2670  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 質量分析イメージング(MSI)によるバイオマーカーの同定は,臨床分野で人気を得ている。しかし,スペクトルと空間変数の複雑さを考慮すると,ハイパースペクトル画像のデータマイニングは困難である。マーカーの発見は,一般的に分類モデルの作成に依存し,検出された識別子m/zの統計的有意性を保証するために検証されるべきである。交差検証(CV)のような再サンプリング法を用いた内部検証は,サンプルサイズが制限され,独立したテストセットが利用できない場合,モデル選択,その一般化性能の推定およびバイオマーカー発見に広く使用されている。ここでは,MSI上の分類モデルの検証のために,多重画像上での制約付きランダムサンプリングCV(CORRS-CV)の使用を初めて導入した。いくつかの側面が考慮されなければならないが(例えば,画像サイズ,CORRS-CV∂値,空間的に近い画素を横切る類似性,全計算時間),CORRS-CVは,生物学的複製の数が少なく,試験のための画像バックの保持が価値ある情報の廃棄物であるときに,生物学的複製を用いてモデル性能のより正確な推定を提供する。さらに,CORRS-CVとランク製品の併用は,複数の画像,特に臨床研究で収集されたヒト組織を分析するとき,生物学的,環境的,技術的変動性の増加に起因する候補バイオマーカーとしての判別特徴の選択のロバスト性を増加させる。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多重化 ,  バイオマーカー ,  データマイニング ,  ロバスト性 ,  画素 ,  ヒト ,  部分最小二乗法 ,  類似性 ,  *判別分析 ,  *特徴選択 ,  スペクトル ,  廃棄物 ,  *無作為抽出
準シソーラス用語： リサンプリング ,  ハイパースペクトル画像 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 質量分析イメージング(MSI) ,  交差検証(CV) ,  制約付き反復ランダムサンプリング ,  交差検証(Corrscv) ,  部分最小二乗判別分析(PLS-DA) ,  特徴選択

分類 (5件)： 質量分析  (CC03013N) ,  分析化学一般  (CC02010H) ,  腫ようの診断  (GE03020J) ,  有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (9件)： 制約 ,  反復 ,  ランダムサンプリング ,  質量分析イメージング ,  判別分析 ,  特徴選択 ,  交差 ,  検証 ,  CV