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J-GLOBAL ID：202002260451786111   整理番号：20A2529859

単一ターンα-ヘリックス抗菌ペプチドのde novo炭化水素-足場設計【JST・京大機械翻訳】

De Novo Hydrocarbon-Stapling Design of Single-Turn α-Helical Antimicrobial Peptides

著者 (5件)： Chen Zhixia (Intensive Care Unit, Yidu Central Hospital Affiliated To Weifang Medical University, Weifang, China) ,  Yu Xiuli (Department of Radiotherapy, Yidu Central Hospital Affiliated To Weifang Medical University, Weifang, China) ,  Zhang Aiying (Department of Orthopaedic Trauma, Yidu Central Hospital Affiliated To Weifang Medical University, Weifang, China) ,  Wang Fangfang (Intensive Care Unit, Yidu Central Hospital Affiliated To Weifang Medical University, Weifang, China) ,  Xing Yankun (Department of Blood Purification, Weifang Traditional Chinese Medicine Hospital, Weifang, China)
資料名： International Journal of Peptide Research and Therapeutics  (International Journal of Peptide Research and Therapeutics)
巻： 26  号： 4  ページ： 1711-1719  発行年： 2020年 
JST資料番号： W4483A  ISSN： 1573-3904  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ほとんどの既存の抗菌ペプチド(AMP)は,細菌外膜との効率的な相互作用を促進する典型的な両親媒性特徴を示すα-ヘリックスとカチオン性である。しかし,短いα-ヘリックスは水中で不安定であり,従って,天然のα-ヘリックスAMPは,一般的に長く,構造的に複雑である。ここでは,ペプチド立体配座を螺旋形に効果的に制約できる炭化水素-ステープリング技術を用いて,単一ターンα-ヘリックスのみを有する非常に単純なAMPのde novo設計を行うことを試みた。設計したAMPはペンタペプチドの各末端に付加的残基を持つヘプタペプチドであり,αターンを定義するための理論的最小である。正味電荷,両親媒性,配列パターン及びアミノ酸組成を系統的に考察し,標準α-ヘリックスヘプタペプチドの螺旋ホイールに基づいて調べ,強い疎水性モーメント及びカチオンと疎水性の間の良好なバランスを有する一連の潜在的一ターン非懸垂AMP候補を誘導した。しかし,構造解析により,これらの設計したAMPは,ヘリシティ<50%でα-ヘリックス立体配座に自発的に折り畳まれないことを示唆した。全炭化水素ブリッジは,いくつかの選択したヘプタペプチドの2番目および6番目の残基を横断して,それらのα-ヘリックス傾向を任意に強制する。円偏光二色性分光法は,スタプリングがこれらのヘプタペプチドの螺旋含量を大きく増強できることを示した。分子動力学シミュレーションは,非stapledペプチドと比較して,ステープルドペプチドが脂質二分子層モデルの膜表面により効率的に浸透し,親水性表面層を横切って迅速に移動することを明らかにした。感受性試験は,スタプリングが抗生物質感受性およびメチシリン耐性S.aureusの両方に対して設計したペプチドの抗菌効力をかなり改善することを明らかにした。透過分析は,ステープルドペプチドが,一般に,それらの非脾臓の対応物より,E.コイル外膜でより高い透過性を有することを確認した。Copyright Springer Nature B.V. 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  電荷 ,  立体配座 ,  細菌 ,  親水性 ,  疎水性 ,  *ペプチド ,  ヘリシティ ,  カチオン ,  両親媒性
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  ペンタペプチド ,  *抗菌ペプチド ,  外膜 ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： - ,  - ,  - ,  - ,  -

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： ヘリックス ,  抗菌ペプチド ,  炭化水素 ,  足場 ,  設計