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J-GLOBAL ID：202002260476736468   整理番号：20A0769037

Locate-R:ヌクレオチド組成を用いた長鎖非コードRNAの細胞内局在化【JST・京大機械翻訳】

Locate-R: Subcellular localization of long non-coding RNAs using nucleotide compositions

著者 (3件)： Ahmad Ahsan (Department of Computer Science and Engineering, United International University, Plot 2, United City, Madani Avenue, Satarkul, Badda, Dhaka 1212, Bangladesh) ,  Lin Hao (School of Life Science and Technology, University of Electronic Science and Technology of China, China) ,  Shatabda Swakkhar (Department of Computer Science and Engineering, United International University, Plot 2, United City, Madani Avenue, Satarkul, Badda, Dhaka 1212, Bangladesh)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 112  号： 3  ページ： 2583-2589  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写RNAの最も多様なクラスの細胞内局在化の知識,長い非コードRNA(lncRNA)は,関連する細胞機能において重要な役割を果たすので,異なるタイプの癌と他の疾患を同定することを導くであろう。近年,既知の記録の指数関数的な成長により,実験室法と比較して提供されるより速くて安価な解により新しい機械学習に基づく技術を確立することが重要になっている。本論文では,lncRNAのサブセル位置を予測するための新しい方法であるLocate-Rを提案した。著者らは,n-ギャップL-mer組成とL-mer組成のみを特徴として用い,モデルを構築するために最良の655の特徴を選択した。このモデルは局所的に深いサポートベクトルマシンに基づいており,最先端の方法に関する予測精度を大幅に向上させる。著者らの予測子は,http://locate-r.azurewebsites.net/からの独立したWeb応用として容易に利用できる。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 指数関数 ,  *RNA【核酸】 ,  *ヌクレオチド ,  Web【情報システム】 ,  機械学習 ,  サポートベクトルマシン
準シソーラス用語： *非翻訳RNA ,  予測子 ,  予測精度 ,  低価格 ,  *細胞内局在 ,  細胞機能 ,  *非翻訳長鎖RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 細胞内局在 ,  長い非コードRNA ,  ヌクレオチド組成 ,  分類 ,  特徴選択 ,  Webアプリケーション機械学習

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB04020F)

タイトルに関連する用語 (4件)： ヌクレオチド ,  組成 ,  長鎖非コードRNA ,  細胞内局在