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J-GLOBAL ID：202002260691193076   整理番号：20A2755644

ヒトおよびマウスの嗅覚受容体遺伝子レパートリーの専門家のキュレーションは,2つのエキソンを隔てる保存されたコード領域を同定する【JST・京大機械翻訳】

Expert curation of the human and mouse olfactory receptor gene repertoires identifies conserved coding regions split across two exons

著者 (18件)： Barnes If H. A. (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Ibarra-Soria Ximena (Cancer Research UK Cambridge Institute, University of Cambridge, Li Ka Shing Centre, Cambridge, UK) ,  Ibarra-Soria Ximena (Wellcome Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Fitzgerald Stephen (Wellcome Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Gonzalez Jose M. (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Davidson Claire (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Hardy Matthew P. (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Manthravadi Deepa (Brandeis University, Waltham, USA) ,  Gerven Laura Van (Department of ENT-HNS, UZ Leuven, Leuven, Belgium) ,  Jorissen Mark (Department of ENT-HNS, UZ Leuven, Leuven, Belgium) ,  Zeng Zhen (Max Planck Research Unit for Neurogenetics, Frankfurt, Germany) ,  Khan Mona (Max Planck Research Unit for Neurogenetics, Frankfurt, Germany) ,  Mombaerts Peter (Max Planck Research Unit for Neurogenetics, Frankfurt, Germany) ,  Harrow Jennifer (ELIXIR, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Logan Darren W. (Wellcome Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Logan Darren W. (Monell Chemical Senses Center, Philadelphia, USA) ,  Logan Darren W. (Waltham Petcare Science Institute, Leicestershire, UK) ,  Frankish Adam (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Wellcome Genome Campus, Cambridge, UK)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 嗅覚受容体(OR)遺伝子は哺乳類ゲノムにおける最大の多遺伝子ファミリーであり,ヒトで874,マウス(偽遺伝子を含む)で1483遺伝子座である。OR遺伝子レパートリーの拡大は,多数の重複事象とそれに続く多様化により生じ,多数の非常に類似したパラログ遺伝子をもたらした。これらの特性は,完全なOR遺伝子レパートリーのアノテーションを複雑なタスクにした。ほとんどのOR遺伝子はin silicoで予測され,典型的にはイントロンレスコード配列として注釈されている。ここでは,ヒトおよびマウス参照ゲノムにおけるあらゆるOR遺伝子を分析し,注釈するための専門家のキュレーションパイプラインを開発した。構造的特徴,進化的保存および実験データからの証拠を結合することにより,これらの遺伝子ファミリーのアノテーションを統一し,各遺伝子座の蛋白質コード能を系統的に決定した。多くのOR遺伝子の非コード領域を定義し,完全長転写物モデルの生成を可能にした。13のヒトと41のマウスOR遺伝子座が2つのエキソンに分裂するコード配列を持つことを見出した。これらの分裂OR遺伝子は哺乳類を通して保存され,イントロンレスコード領域を持つ蛋白質コードOR遺伝子と同じレベルで発現する。著者らの知見は,脊椎動物のOR遺伝子のコード領域が単一エキソン内に含まれているという長年の広範な概念に挑戦する。本研究は,今日までヒトおよびマウスOR遺伝子レパートリーの最も包括的なキュレーション努力を提供する。完全なアノテーションを,研究コミュニティへの即時アベイラビリティのためにGENCODE参照遺伝子セットに統合した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： コミュニティ ,  *遺伝子 ,  脊椎動物 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  哺乳類 ,  アベイラビリティ ,  ゲノム ,  偽遺伝子 ,  アノテーション
準シソーラス用語： 非翻訳領域 ,  *嗅覚受容体 ,  in silico ,  パラロガス遺伝子 ,  遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 嗅覚受容体遺伝子 ,  アノテーション ,  キュレーション ,  マウス ,  ヒト

分類 (3件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  その他の感覚  (EJ13040X) ,  細胞膜の受容体  (EF04030C)

引用文献 (63件)：

• Cell; A novel multigene family may encode odorant receptors: a molecular basis for odor recognition; L Buck, R Axel; 65; 1; 1991; 175-187; 10.1016/0092-8674(91)90418-X; citation_id=CR1
• Cell; Combinatorial receptor codes for odors; B Malnic, J Hirono, T Sato, LB Buck; 96; 5; 1999; 713-723; 10.1016/S0092-8674(00)80581-4; citation_id=CR2
• Genome Res; The complete human olfactory subgenome; G Glusman, I Yanai, I Rubin, D Lancet; 11; 5; 2001; 685-702; 10.1101/gr.171001; citation_id=CR3
• Nat Neurosci; The olfactory receptor gene superfamily of the mouse; X Zhang, S Firestein; 5; 2; 2002; 124-133; 10.1038/nn800; citation_id=CR4
• Methods Mol Biol; HORDE: comprehensive resource for olfactory receptor genomics; T Olender, N Nativ, D Lancet; 1003; 2013; 23-38; 10.1007/978-1-62703-377-0_2; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： ヒト ,  マウス ,  嗅覚 ,  受容体遺伝子 ,  エキソン ,  保存 ,  同定