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J-GLOBAL ID：202002260731348760   整理番号：20A1018305

運動論的遷移ネットワークの定義,計算,および収束観測量【JST・京大機械翻訳】

Defining, Calculating, and Converging Observables of a Kinetic Transition Network

著者 (2件)： Swinburne Thomas D. (Aix-Marseille Universite, CNRS, CINaM UMR 7325, France) ,  Wales David J. (Department of Chemistry, University of Cambridge, United Kingdom)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 16  号： 4  ページ： 2661-2679  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 局所極小および遷移状態の速度論的遷移ネットワーク(KTNS)は,化学,生物学および材料科学における多数の系の動力学を捉えることができる。しかし,観測量を抽出することは,大規模ネットワークに対して数値的に挑戦的であり,一般的に付加的な計算発見に敏感である。観測量に対する収束の測定を行うためには,これらの感度を定期的に計算しなければならない。KTNSに対する離散経路サンプリングフレームワークの行列定式化を示し,分岐確率,遷移速度,待ち時間に対する表現を導出した。準定常分布の概念を用いて,正確な結果から定常状態近似へのネットワーク観測量の表現の明確な階層を確立した。これらの結果をグラフ変換法と組み合わせて用いて,既知のKTNの摂動に関して感度を導出し,対感度に対する明示的項を与え,経路感度を検討した。これらの結果は,生成物と反応物状態の間の全体的な速度係数に対して得られた推定値に焦点を合わせて,追加サンプリングに関してネットワークを収束させるためのガイドラインを提供する。著者らは,38原子Lennard-Jonesクラスタの二重漏斗景観における遷移に対するこの手順を実証した。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  近似法 ,  遷移状態 ,  速度論 ,  クラスタ ,  待ち時間 ,  推定量 ,  定式化 ,  材料科学
準シソーラス用語： グラフ変換 ,  定常状態 ,  大規模ネットワーク ,  反応物 ,  *運動学的理論 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (5件)： 計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  分子の電子構造  (BH05010Q) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  数値計算  (JE02000J) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： 運動論 ,  遷移 ,  定義 ,  計算 ,  収束