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J-GLOBAL ID：202002260795770915   整理番号：20A0330614

異なる配列を持つ一本鎖DNAとヒトリボソーム蛋白質US3の相互作用の探索【JST・京大機械翻訳】

Exploring the Interaction of Human Ribosomal Protein uS3 with Single-Stranded DNAs Having Different Sequences

著者 (6件)： Ochkasova A. S. (Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch, Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russia) ,  Kabilov M. R. (Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch, Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russia) ,  Karpova G. G. (Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch, Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russia) ,  Karpova G. G. (Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia) ,  Graifer D. M. (Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Siberian Branch, Russian Academy of Sciences, Novosibirsk, Russia) ,  Graifer D. M. (Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russia)
資料名： Russian Journal of Bioorganic Chemistry  (Russian Journal of Bioorganic Chemistry)
巻： 45  号： 6  ページ： 619-624  発行年： 2019年 
JST資料番号： W4914A  ISSN： 1068-1620  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ChIP-Seq法により以前に得られたヒトリボソーム蛋白質US3の結合部位におけるゲノムDNA配列に関するデータの解析を行った。ヒト衛星のタイプIIIに属するTGGAAリピートの有意な含有量の存在が見出された。対応する組換え蛋白質US3の一本鎖DNAへの親和性の依存性と,in vitroでのDNA配列に対するそのAPリアーゼ活性,特にTGGAA五量体反復の存在に対する依存性を調べた。モデルDNAにおけるこれらの反復の存在は分離リボソーム蛋白質US3に対する親和性の増加をもたらさないことを示した。対応する五量体三重項に相補的なDNAにおけるTCCおよびTTCモチーフの存在は,この蛋白質へのDNAの親和性をわずかに増加させた。US3蛋白質のAPリアーゼ活性もTGGAA反復を含むDNAの場合には増加せず,AP部位の位置に依存しないことを確立した。AP部位における一本鎖DNA切断の効率は,このDNAに対するUS3蛋白質の親和性と全体的に相関することを示した。クロマチン上のリボソーム蛋白質US3結合部位における上記反復の高含量は,蛋白質結合に物理的にアクセス可能な一本鎖DNA領域における高含量(TGGAA)n反復に関連するが,五量体又はDNAモチーフに対する高親和性は相補的であると結論した。Copyright Pleiades Publishing, Ltd. 2019 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *一本鎖DNA ,  結合部位 ,  組換タンパク質 ,  *リボソームタンパク質 ,  親和性 ,  クロマチン ,  *ヒト ,  *タンパク質 ,  *DNA【核酸】 ,  タンパク質結合 ,  in vitro実験 ,  *リボソーム ,  *相互作用 ,  サテライトDNA
準シソーラス用語： 脱塩基部位 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： リボソームUS3蛋白質 ,  一本鎖DNA ,  DNAへの蛋白質結合 ,  DNAにおける脱塩基部位 ,  APリアーゼ活性 ,  サテライトDNA

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 一本鎖DNA ,  ヒト ,  リボソーム蛋白質 ,  相互作用 ,  探索