NPGSスーダンのソルガムのコアコレクションにおける遺伝的多様性,農業形質および炭疽病抵抗性の評価【JST・京大機械翻訳】

Cuevas Hugo E.; Prom Louis K.

文献

J-GLOBAL ID：202002261491933019 整理番号：20A0973491

NPGSスーダンのソルガムのコアコレクションにおける遺伝的多様性,農業形質および炭疽病抵抗性の評価【JST・京大機械翻訳】

Evaluation of genetic diversity, agronomic traits, and anthracnose resistance in the NPGS Sudan Sorghum Core collection

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巻： 21 号： 1 ページ： 1-15 発行年： 2020年
JST資料番号： U7048A ISSN： 1471-2164 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

米国農務省(USDA)国立植物生殖質システム(NPGS)モロコシのコア収集は,77の国からランダムに選択された3011の系統を含んでいる。このコア収集のゲノムおよび表現型特性化は,育種計画におけるその利用を奨励し,容易にし,保存努力を改善するために必要である。本研究では,NPGS Sudanモロコシのコアセットに属する318系統のゲノム配列を調べ,それらの農業形質と炭そ病抵抗性応答を特性化した。遺伝子タイピング(GBS)アプローチを用いて,25124の注釈遺伝子の内または近傍に位置する183,144の一塩基多型(SNP)を同定した。コア収集は遺伝的に非常に多様で,系統間の平均ペアワイズ遺伝距離は0.76であった。個体群構造とクラスタ分析は,Sudanコアセット内の5つの祖先集団を明らかにし,中程度から高レベルの遺伝的分化を示した。全体で,171系統(54%)はこれらの個体群の1つに割り当てられ,全ゲノム変異の96%をカバーした。TajimaのD値に基づくゲノムスキャンは,均衡選択の下で2つの個体群を明らかにした。表現型分析は,個体群間の農業形質の違いを示し,これらの個体群が異なる生態地理学的領域に属することを示唆した。合計55の系統が炭そ病に耐性であった。これらの系統は複数の耐性源を表すことができた。固定およびランダムモデル循環能力(農場CPU)に基づく全ゲノム関連研究により,植物高,開花時間,穂長および直径および炭そ病抵抗性応答に関連するゲノム領域を同定した。Sudanコアセットとソルガム関連パネルの統合分析は,Sudanコアセットにおける遺伝的変異の大部分が育種プログラムに存在する可能性があるが,系統のいくつかのクラスタ内では利用されていないことを示した。NPGS Sudanコア収集は,遺伝的および表現型的に多様な生殖質から成り,複数の炭そ病耐性源を有する。集団ゲノム解析はスクリーニング努力を改善し,育種計画のための最も価値ある生殖質を同定するために使用できる。本研究で生成した新しいGBSデータセットは,NPGSモロコシ収集の遺伝的多様性をマイニングすることに興味を持つ植物育種家のための新しいゲノム資源を表す。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学 , 菌類による植物病害

引用文献 (76件)：

Field Crop Res; Identification of diverse germplasm lines for agronomic traits in a chickpea (Cicer arietinum L.) core collection for use in crop improvement; HD Upadhyaya, SL Dwivedi, CLL Gowda, S Singh; 100; 2007; 320-326; 10.1016/j.fcr.2006.08.008; citation_id=CR1
Plant genetic resources today: a critical appraisal; Crop Genetic Resources: Conservation and Evaluation; 1984; 249-257; CR2; OH Frankel, B AHD; citation_publisher=George Allen & Unwin
Crop Sci; Comparison of representative and custom methods of generating core subsets of a carrot germplasm collection; KE Corak, SL Ellison, PW Simon, DM Spooner, JC Dawson; 59; 2019; 1107-1121; 10.2135/cropsci2018.09.0602; citation_id=CR3
Crop Sci; Core collection of sorghum: I. stratification based on eco-geographical data; C Grenier, PJ Bramel-Cox, P Hamon; 41; 1; 2001; 234-240; 10.2135/cropsci2001.411234x; citation_id=CR4
Crop Sci; Core collection of sorghum: II. Comparison of three random sampling strategies; C Grenier, P Hamon, PJ Bramel-Cox; 41; 1; 2001; 241-246; 10.2135/cropsci2001.411241x; citation_id=CR5

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