文献

J-GLOBAL ID：202002261777650060   整理番号：20A2577856

機械学習による頭頸部扁平上皮癌患者の生存を予測するための8-mRNAsiベース署名の同定【JST・京大機械翻訳】

Identifying 8-mRNAsi Based Signature for Predicting Survival in Patients With Head and Neck Squamous Cell Carcinoma via Machine Learning

著者 (12件)： Tian Yuxi (Department of Oncology, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Wang Juncheng (Department of Otolaryngology Head and Neck Surgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Qin Chao (Department of Neurosurgery, The First People’s Hospital of Changde City, Changde, China) ,  Zhu Gangcai (Department of Otolaryngology Head and Neck Surgery, The Second Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Chen Xuan (Department of Stomatology, Changzheng Hospital, Second Military Medical University, Shanghai, China) ,  Chen Zhixiang (Hainan General Hospital, Hainan Affiliated Hospital of Hainan Medical University, Haikou, China) ,  Qin Yuexiang (Department of Health Management, The Third Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Wei Ming (Department of Otolaryngology Head and Neck Surgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Li Zhexuan (Department of Otolaryngology Head and Neck Surgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Zhang Xin (Department of Otolaryngology Head and Neck Surgery, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha, China) ,  Lv Yunxia (Department of Thyroid Surgery, The Second Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Cai Gengming (Department of Otolaryngology Head and Neck Surgery, First Affiliated Hospital of Quanzhou, Fujian Medical University, Quanzhou, China)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 566159  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 癌幹細胞(CSC)は,分化,自己再生,およびホメオスタシス制御を含むいくつかの排他的特徴によって特徴付けられ,腫瘍の維持と広がりを可能にする。頭頚部扁平上皮癌(HNSCC)の再発と治療抵抗性はCSCに起因すると同定された。しかし,バイオマーカーはHNSCC幹細胞の発達に繋がった。この研究では,mRNA発現に基づく幹細胞性インデックス(mRNAsi)により癌幹細胞性を定量し,mRNAiインデックスが正常組織よりHNSCC組織でより高いことを見出した。HPV陰性患者よりもHPV陽性患者において,女性患者よりも男性患者において有意に高いmRNAiが観察された。8-mRNAsiシグネチャは,主に加重遺伝子共発現ネットワーク分析によってスクリーニングしたmRNAiに関連する2つのモジュールにおける遺伝子から同定された。この予後的特徴において,RGS16,LYVE1,ΔC,ANP32A,およびAIMP1の高発現は,細胞増殖と腫瘍進行の促進に焦点を合わせる。ZNF66,PIK3R3およびMAP2K7は死亡リスクが低い。8つの署名のリスクスコアは,全生存予測(5年AUC0.77,95%CI0.69-0.85)の1,3-,5年に対して強力な能力を有した。幹細胞性指数に基づくこれらの知見は,HNSCC幹細胞を抑制するための標的療法の新しい理解を提供するかもしれない。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  腫瘍 ,  細胞増殖 ,  ホメオスタシス ,  予後 ,  幹細胞 ,  バイオマーカー ,  *機械学習 ,  分子標的療法
準シソーラス用語： 腫瘍幹細胞 ,  腫瘍進行 ,  共発現 ,  *頭頚部扁平上皮癌 ,  mRNA発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 癌細胞の幹細胞性指数 ,  頭頸部扁平上皮癌 ,  癌ゲノムアトラス ,  重み付き遺伝子共発現ネットワーク解析 ,  予測モデル

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  腫ようの診断  (GE03020J)

引用文献 (41件)：

• BlanpainC.LowryW. E.GeogheganA.PolakL.FuchsE. (2004). Self-renewal, multipotency, and the existence of two cell populations within an epithelial stem cell niche. Cell 118 635-648. doi: 10.1016/j.cell.2004.08.012 15339667
• ChaturvediA. K.EngelsE. A.PfeifferR. M.HernandezB. Y.XiaoW.KimE. (2011). Human papillomavirus and rising oropharyngeal cancer incidence in the United States. J. Clin. Oncol. 29 4294-4301.
• ChenY.DengG.FuY.HanY.GuoC.YinL. (2020). FOXC2 Promotes Oxaliplatin Resistance by Inducing Epithelial-Mesenchymal Transition via MAPK/ERK Signaling in Colorectal Cancer. Onco. Targets Ther. 13 1625-1635. doi: 10.2147/ott.s241367 32110058
• CramerJ. D.BurtnessB.LeQ. T.FerrisR. L. (2019). The changing therapeutic landscape of head and neck cancer. Nat. Rev. Clin. Oncol. 16 669-683. doi: 10.1038/s41571-019-0227-z 31189965
• FischlH.NeveJ.WangZ.PatelR.LoueyA.TianB. (2019). hnRNPC regulates cancer-specific alternative cleavage and polyadenylation profiles. Nucl. Acids Res. 47 7580-7591. doi: 10.1093/nar/gkz461 31147722

タイトルに関連する用語 (7件)： 機械学習 ,  頭頸部扁平上皮癌 ,  患者 ,  生存 ,  予測 ,  署名 ,  同定