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J-GLOBAL ID：202002262051679626   整理番号：20A2755670

異質六倍体コムギの若い穂におけるPHAS遺伝子座の進化【JST・京大機械翻訳】

Evolution of PHAS loci in the young spike of Allohexaploid wheat

著者 (32件)： Zhang Rongzhi (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Zhang Rongzhi (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Zhang Rongzhi (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Huang Siyuan (BGI Institute of Applied Agriculture, Shenzhen, China) ,  Li Shiming (BGI Institute of Applied Agriculture, Shenzhen, China) ,  Song Guoqi (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Song Guoqi (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Song Guoqi (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Li Yulian (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Li Yulian (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Li Yulian (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Li Wei (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Li Wei (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Li Wei (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Li Jihu (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Li Jihu (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Li Jihu (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Gao Jie (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Gao Jie (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Gao Jie (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Gu Tiantian (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Gu Tiantian (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Gu Tiantian (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Li Dandan (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Li Dandan (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Li Dandan (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Zhang Shujuan (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Zhang Shujuan (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Zhang Shujuan (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China) ,  Li Genying (Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, China) ,  Li Genying (Key Laboratory of Wheat Biology and Genetic Improvement on North Yellow and Huai River Valley, Ministry of Agriculture, Jinan, China) ,  Li Genying (National Engineering Laboratory for Wheat and Maize, Jinan, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-19  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： PhasiRNA(フェーズド二次siRNA)は,植物における発生過程および生物的または非生物的ストレスにおいて重要な調節的役割を果たす。phasiRNAのいくつかは,2つのカテゴリー,21-nt(ヌクレオチド)および24-nt phasiRNAを含む草本における生殖発達に関与する。それらは,イネ,トウモロコシおよび他の草種の減数分裂および減数分裂葯において,それぞれmiR2118およびmiR2275によって誘発された。3つの密接に関連するサブゲノム(サブA,サブBおよびサブD)を有するコムギ(Triticum aestivum)は,植物における異質倍数体のモデルである。コムギの花序発生におけるphasiRNAの役割に関する知識はこれまで存在せず,倍数体植物におけるPHAS遺伝子座の進化も利用できない。種々の組織からの261の低分子RNA発現データセットを用いて,PHAS(phasiRNA前駆体)遺伝子座のバッチを,コムギの若いスパイクで同定し,その多くは,それらの標的部位領域でmiR2118とmiR2275によって調節されていた。Triticumの2倍体(AAおよびDD),四倍体(AABB)および六倍体(AABBDD)ゲノム間のPHASおよびそれらのトリガーmiRNAの切断は,PHAS遺伝子座の分布は局所染色体においてランダムに優勢であったが,miR2118はサブBゲノムにおいてのみ優勢であることを示した。コムギおよびそれらの前駆体ゲノム(AA,DDおよびAABB)の3つのサブゲノムにおけるPHAS遺伝子座の多様性は,それらが4倍体AABBゲノムの発生前に少なくとも発生または分岐したことを示唆した。PHAS遺伝子座またはトリガーmiRNAとゲノムの倍数性との間の正の相関は,ゲノムの拡大がPHAS遺伝子座の増加およびTriticumにおけるそれらのトリガーmiRNAに対する主要な駆動力であることを示した。加えて,PHAS転写物の発現プロファイルは,それらがコムギの寒冷ストレスのような非生物的ストレスに応答することを示唆した。まとめると,非コードphasiRNAは,Triticumゲノムにおいて迅速な可塑性を示す転写制御因子である。それらはコムギの生殖発達と非生物的ストレスに関与する可能性がある。それは,Triticumにおける雄の生殖発達に関する分子研究を参照することができた。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 減数分裂 ,  *コムギ ,  生殖 ,  ゲノム ,  寒冷ストレス ,  花序 ,  四倍体 ,  倍数体 ,  二倍体 ,  *六倍体 ,  コムギ属 ,  siRNA
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  非生物的ストレス ,  異質倍数体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： PhasiRNA ,  PHAS ,  マイクロRNA ,  進化 ,  若いスパイク ,  コムギ

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  発生,成長,分化  (EH02030U)

引用文献 (51件)：

• Plant Cell; Phased, secondary, small interfering RNAs in posttranscriptional regulatory networks; Q Fei, R Xia, BC Meyers; 25; 7; 2013; 2400-2415; 10.1105/tpc.113.114652; citation_id=CR1
• Plant Biotechnol J; Biogenesis and regulatory hierarchy of phased small interfering RNAs in plants; P Deng, S Muhammad, M Cao, L Wu; 16; 5; 2018; 965-975; 10.1111/pbi.12882; citation_id=CR2
• Genome Res; Clusters and superclusters of phased small RNAs in the developing inflorescence of rice; C Johnson, A Kasprzewska, K Tennessen, J Fernandes, GL Nan, V Walbot, V Sundaresan, V Vance, LH Bowman; 19; 8; 2009; 1429-1440; 10.1101/gr.089854.108; citation_id=CR3
• Genes Dev; A novel class of small RNAs in mouse spermatogenic cells; ST Grivna, E Beyret, Z Wang, H Lin; 20; 13; 2006; 1709-1714; 10.1101/gad.1434406; citation_id=CR4
• Proc Natl Acad Sci U S A; MicroRNA regulation of plant innate immune receptors; F Li, D Pignatta, C Bendix, JO Brunkard, MM Cohn, J Tung, H Sun, P Kumar, B Baker; 109; 5; 2012; 1790-1795; 10.1073/pnas.1118282109; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (4件)： 六倍体 ,  コムギ ,  穂 ,  進化