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J-GLOBAL ID：202002262481446395   整理番号：20A1925098

in vitro研究の改良された標準化のためのデジタル多重連結依存性プローブ増幅を用いたハイスループット分子癌細胞系特性化【JST・京大機械翻訳】

High-Throughput Molecular Cancer Cell Line Characterization Using Digital Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification for Improved Standardization of in Vitro Research

著者 (7件)： Menezes Karen (Division of Molecular Pathology, The Institute of Cancer Research, London, United Kingdom) ,  Atanesyan Lilit (Department of Oncogenetics, MRC Holland, Amsterdam, the Netherlands) ,  Sherborne Amy L. (Division of Molecular Pathology, The Institute of Cancer Research, London, United Kingdom) ,  Steenkamer Maryvonne (Department of Oncogenetics, MRC Holland, Amsterdam, the Netherlands) ,  Clemens Ivo (Department of Bioinformatics, MRC Holland, Amsterdam, the Netherlands) ,  Savola Suvi (Department of Oncogenetics, MRC Holland, Amsterdam, the Netherlands) ,  Kaiser Martin F. (Division of Molecular Pathology, The Institute of Cancer Research, London, United Kingdom)
資料名： Journal of Molecular Diagnostics  (Journal of Molecular Diagnostics)
巻： 22  号： 9  ページ： 1179-1188  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3144A  ISSN： 1525-1578  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腫瘍細胞株は癌研究に広く利用されるが,細胞系同一性,交差汚染,および腫瘍体細胞分子安定性の品質管理に関する課題は,従来の短いタンデム反復プロファイリングを超える新たなアプローチを要求する。公共リポジトリから得た合計21の一般的に使用される多発性骨髄腫細胞株を,生殖系列単一ヌクレオチド多型,挿入/欠失,および体細胞コピー数異常(CNAs)を特徴づけるために,デジタル多重結紮依存性プローブ増幅(ディジタルMLPA)によって分析した。発生プロファイルと社内開発分析パイプラインを用いて,ブラインド実験を行い,41の匿名化細胞株試料における細胞株同一性と潜在的スパイクインDNA汚染を予測するデジタルMLPAの能力を決定した。優性細胞系はすべての場合で正しく同定され,交差汚染はスパイクインDNAの37試料の33試料において正しく検出された。偽陽性予測はなかった。スパイクが検出されなかった4つの試料は,汚染の低レベル(1%)をすべて実行しなかったが,一方,≧5%の汚染レベルは,すべての場合で正しく同定された。CNAプロファイルの教師なしクラスタリングは,Ig重遺伝子座転座事象の開始と相関する共有共通性を同定した。9つの細胞株の縦断的CNA評価は,挿入/欠失プロファイリングだけで検出されなかった標準培養条件下で変化を明らかにした。結果は,デジタルMLPAが,in vitro癌研究の高度な品質保証のための高スループットツールとして利用できることを示唆する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 品質管理 ,  *標準化 ,  DNA【核酸】 ,  腫瘍 ,  *腫瘍細胞 ,  *多重化 ,  結紮術 ,  転座 ,  コピー数 ,  多発性骨髄腫 ,  *in vitro実験 ,  リポジトリ ,  一塩基多型
準シソーラス用語： *細胞株 ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  基礎腫よう学一般  (GE02010R)

タイトルに関連する用語 (11件)： 研究 ,  標準化 ,  デジタル ,  多重 ,  依存性 ,  プローブ ,  増幅 ,  ハイスループット ,  分子 ,  癌細胞 ,  特性化