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J-GLOBAL ID：202002263457173000   整理番号：20A1739073

中国,海南におけるヒトから収集したBurkholderia pseudomalleiの分子特性【JST・京大機械翻訳】

Molecular Characteristics of Burkholderia pseudomallei Collected From Humans in Hainan, China

著者 (10件)： Zhu Xiong (Sanya People’s Hospital, Sanya, China) ,  Chen Hai (Sanya People’s Hospital, Sanya, China) ,  Li Sha (Sanya People’s Hospital, Sanya, China) ,  Wang Li-cheng (Sanya People’s Hospital, Sanya, China) ,  Wu Duo-rong (Haikou People’s Hospital, Haikou, China) ,  Wang Xu-ming (Hainan General Hospital, Haikou, China) ,  Chen Ru-shou (The Third People’s Hospital of Hainan Province, Sanya, China) ,  li Zhen-jun (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control, China Center for Disease Control and Prevention, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Beijing, China) ,  Liu Zhi-guo (Sanya People’s Hospital, Sanya, China) ,  Liu Zhi-guo (State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control, China Center for Disease Control and Prevention, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Beijing, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 778  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Melioidosisは東南アジアとオーストラリア北部の一般的な感染症である。海南では,いくつかの事例が報告されているが,生物の分子疫学プロファイルに関する系統的研究はまだ行われていない。Burkholderia pseudomalleiの分子疫学リンクと個体群構造の研究は,分離株のクローンとそれらの間の差異をより良く理解するのに役立つであろう。本研究では,多遺伝子座可変数タンデム反復分析(MLVA)と多遺伝子座配列タイピング(MLST)を適用して,中国,海南の2002~2014年の間に得られた166のB.pseudomallei分離株の疫学的関連性と個体群構造を調べた。MLVA_4とMLSTアプローチの両方は,この個体群に対して高い識別力を持ち,それぞれ0.9899と0.9457の多様度指数を有した。しかし,MLVA_4アッセイはMLSTアプローチよりも高い識別力を示し,MLVAアプローチにより見出された可変数タンデム反復(VNTR3933)はこの省からの菌株の識別に最も有用であった。合計166の菌株は99のMLVA_4遺伝子型をもたらし,その内の34の遺伝子型が101の分離株によって共有され,60.8%(101/166)のクラスタ化率のために,いくつかのケースが共通のソースを持つかもしれないことを示唆した。さらに,65の分離株は,異なる遺伝子型を示し,海南のメリシオーシス症例の39.2%以上(65/166)が疫学的に無関係または散発的な特性を持つことを示した。166の分離株は48のSTsに分解され,そのうち5つのSTs(ST55,-70,-46,-50,-58)が優勢であった。eBURST v3を用いて行った116の分離株の系統発生解析は,予測創始者としてST50を有する48のSTsを分離し,そして,21のSTsは単一トンであることが判明し,それは海南地域の株がSTクローンの高い多様性を表し,多くのB.pseudomalleiクローン群がこの領域に固有であることを示した。さらに,ST50は5SLV,7DLV,6TLV,および29衛星STsを有し,放射状拡大パターンを形成し,本研究におけるメリシオーシス流行がST50のクローン拡大により主に引き起こされることを示唆した。地球規模の系統解析は,中国の分離株が東南アジア,特にタイとマレーシアからの分離株と密接に関連することを示唆する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  ヒト ,  系統発生 ,  クラスタ化 ,  感染症 ,  クローン ,  個体群 ,  疫学 ,  *Burkholderia
準シソーラス用語： *Burkholderia pseudomallei ,  分子疫学 ,  縦列反復配列 ,  多座位配列タイピング ,  MLVA法 ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： メリオーシス ,  Burkholderia pseudomallei ,  分子特性 ,  MLVA ,  MLST ,  海洋海南

分類 (5件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  疫学  (GB03000E) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  微生物検査  (GC02030H) ,  細菌による動物の伝染病  (FE02023A)

引用文献 (36件)：

• Archana P., Duraipandian T., Ashu K., Ajith K., Sonia A., Sapana T., et al (2014). Isolation, identification and characterization of Burkholderia pseudomallei from soil of coastal region of India. Springerplus 3:438. doi: 10.1186/2193-1801-3-438
• Cheng A. C., Currie B. J. (2005). Melioidosis: epidemiology, pathophysiology, and management. Clin. Microbiol. Rev. 18 383-416. doi: 10.1128/cmr.18.2.383-416.2005
• Cheng A. C., Ward L., Godoy D., Norton R., Mayo M., Gal D., et al (2008). Genetic diversity of Burkholderia pseudomallei isolates in Australia. J. Clin. Microbiol. 46 249-254. doi: 10.1128/jcm.01725-07
• Currie B. J., Dance D. A., Cheng A. C. (2008). The global distribution of Burkholderia pseudomallei and melioidosis: an update. Trans. R. Soc. Trop Med. Hyg. 102(Suppl. 1), S1-S4. doi: 10.1128/jcm.01725-07
• Currie B. J., Fisher D. A., Anstey N. M., Jacups S. P. (2000). Melioidosis: acute and chronic disease, relapse and re-activation. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 94 301-304. doi: 10.1016/s0035-9203(00)90333-x

タイトルに関連する用語 (5件)： 中国 ,  ヒト ,  収集 ,  Burkholderia ,  分子特性