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J-GLOBAL ID：202002263702611973   整理番号：20A1638018

チベットのMeconopsis grandis Prainから単離したNeonectria sp.DH2のドラフトゲノム配列【JST・京大機械翻訳】

Draft genome sequence of Neonectria sp. DH2 isolated from Meconopsis grandis Prain in Tibet

著者 (8件)： Lin Xiaojing (School of Marine Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Lin Xiaojing (Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine, Guangzhou, China) ,  Xu Hui (Research Center of Chinese Herbal Resource Science and Engineering, Guangzhou University of Chinese Medicine, Guangzhou, China) ,  Liu Lan (School of Marine Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Liu Lan (Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory (Zhuhai), Zhuhai, China) ,  Li Huixian (School of Marine Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Gao Zhizeng (School of Marine Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Gao Zhizeng (Southern Marine Science and Engineering Guangdong Laboratory (Zhuhai), Zhuhai, China)
資料名： 3 Biotech  (3 Biotech)
巻： 10  号： 8  ページ： 346  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3974A  ISSN： 2190-5738  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,チベットのMeconopsis grandis Prainから単離した内生菌であるNeonectria sp.DH2の高品質ドラフトゲノム配列を報告する。全ゲノムは約45.8Mbpで,GC含有量は53%であった。全部で14,163の遺伝子が蛋白質をコードすると予測され,それらの557は5つの遺伝子データベースで見つからないので,ユニークと考えられる。内部転写スペーサー(ITS)領域配列に基づく隣接結合系統樹は,Neonectria sp.DH2がNeonectria ramulariaeに最も密接に関連することを示した。47の生合成遺伝子クラスター(BGC)をNeonectria sp.DH2ゲノムで同定し,5つのBGCのみが以前に報告されたBGCと有意な類似性を示した。Neonectria sp.DH2における42のユニークなBGCの存在は,それが新規な二次代謝産物を生産する大きな可能性を有することを示唆する。Copyright King Abdulaziz City for Science and Technology 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生合成 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  系統樹 ,  スペーサ ,  *ゲノム ,  チベット自治区 ,  類似性 ,  単離 ,  二次代謝産物
準シソーラス用語： 遺伝子データベース ,  内生菌 ,  *ゲノム配列 ,  遺伝子クラスタ ,  高品質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Neonectria sp.DH2 ,  内生菌 ,  ドラフトゲノム ,  二次代謝産物

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： チベット ,  単離 ,  ドラフト ,  ゲノム配列