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J-GLOBAL ID：202002263849730942   整理番号：20A2707412

2Dおよび弾性再構成3D-MALDI MS画像におけるAlzheimerアミロイドプラーク組成のコンピュータ解析【JST・京大機械翻訳】

Computational Analysis of Alzheimer Amyloid Plaque Composition in 2D- and Elastically Reconstructed 3D-MALDI MS Images

著者 (18件)： Enzlein Thomas (Center for Mass Spectrometry and Optical Spectroscopy (CeMOS), Mannheim University of Applied Sciences, Germany) ,  Enzlein Thomas (KU Leuven-VIB Center for Brain & Disease Research, VIB, Belgium) ,  Enzlein Thomas (Department of Neurosciences, Leuven Institute for Neuroscience and Disease, KU Leuven, Belgium) ,  Cordes Jonas (Faculty of Computer Science, University of Applied Sciences Mannheim, Germany) ,  Munteanu Bogdan (Center for Mass Spectrometry and Optical Spectroscopy (CeMOS), Mannheim University of Applied Sciences, Germany) ,  Michno Wojciech (Department of Psychiatry and Neurochemistry, Sahlgrenska Academy at the University of Gothenburg, Sweden) ,  Michno Wojciech (Department of Neuroscience, Physiology and Pharmacology, University College London, United Kingdom) ,  Serneels Lutgarde (KU Leuven-VIB Center for Brain & Disease Research, VIB, Belgium) ,  Serneels Lutgarde (Department of Neurosciences, Leuven Institute for Neuroscience and Disease, KU Leuven, Belgium) ,  De Strooper Bart (KU Leuven-VIB Center for Brain & Disease Research, VIB, Belgium) ,  De Strooper Bart (Department of Neurosciences, Leuven Institute for Neuroscience and Disease, KU Leuven, Belgium) ,  De Strooper Bart (UK Dementia Research Institute at UCL, University College London, U.K.) ,  Hanrieder Joerg (Department of Psychiatry and Neurochemistry, Sahlgrenska Academy at the University of Gothenburg, Sweden) ,  Hanrieder Joerg (Department of Neurodegenerative Diseases, University College London Queen Square Institute of Neurology, United Kingdom) ,  Wolf Ivo (Faculty of Computer Science, University of Applied Sciences Mannheim, Germany) ,  Chavez-Gutierrez Lucia (KU Leuven-VIB Center for Brain & Disease Research, VIB, Belgium) ,  Chavez-Gutierrez Lucia (Department of Neurosciences, Leuven Institute for Neuroscience and Disease, KU Leuven, Belgium) ,  Hopf Carsten (Center for Mass Spectrometry and Optical Spectroscopy (CeMOS), Mannheim University of Applied Sciences, Germany)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 92  号： 21  ページ： 14484-14493  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： MALDI質量分析イメージング(MSI)は,組織切片中の広範囲の検体の無標識で空間的に分解された分析を可能にする。MSIデータセットの定量的分析は,単一ピクセルまたは手動で割り当てられた関心領域(ROI)で典型的に実行される。しかしながら,プラークと呼ばれるアミロイドペプチドのAlzheimer病(AD)脳沈着のような,多くの疎な,小さな対象は,単一ピクセルもROIもしない。ここでは,異種アミロイドペプチド組成の統計的評価を可能にする高速PLAQUE PICKERツール,MSIによるアミロイドプラーク様物体の比較計算評価を容易にする新しいアプローチを提案した。2つのADマウスモデル,APP NL-G-FとAPP PS1を比較し,NL-G-Fモデルで異なる不均一なプラーク集団を同定したが,PS1モデルでは1クラスのプラークのみを同定した。技術的および生物学的MSI複製の比較のための定量的計量を提案した。さらに,構造化およびプラーク非関連参照イオン画像を用いた剛体および弾性MSI画像記録を用いて,完全自動化様式でアミロイドプラークの高精度3Dモデルを再構成した。再構成された3D-MSI対象物における統計的単一プラーク分析は,Aβ_1-42Arcペプチドが,より大きなプラークのコアまたは他のAβイソ型の共局在のない小さなプラークのどちらかに位置することを明らかにした。3Dでは,2D-MSIデータで示されたものより,実質的に大きな数の小さいプラークが観察され,分子的に多様なスパース分布の特徴の定量的分析は3D再構成から恩恵を受けることを示唆した。データは,識別子PXD020824によるプロテオームX変化を介して利用可能である。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *弾性 ,  ペプチド ,  *アミロイド ,  画像処理 ,  定量的分析 ,  画素 ,  *二次元 ,  *プラーク ,  *三次元 ,  沈着 ,  *Alzheimer病 ,  *MALDI-MS ,  プロテオーム ,  *アミロイド斑
準シソーラス用語： 組織切片 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (8件)： 2D ,  弾性 ,  再構成 ,  3D ,  Alzheimer ,  アミロイドプラーク ,  組成 ,  コンピュータ解析