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J-GLOBAL ID：202002263909249457   整理番号：20A0123194

比較トランスクリプトーム解析は3つの病原体感染下のヤツメウナギ幼生の免疫応答に対する洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Comparative transcriptomic analysis provides insights into immune responses of lamprey larvae under three pathogens infections

著者 (17件)： Gou Meng (College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Gou Meng (Lamprey Research Center, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Gou Meng (Collaborative Innovation Center of Seafood Deep Processing, Dalian Polytechnic University, 116023, China) ,  Ma Lie (College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Ma Lie (Lamprey Research Center, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Ma Lie (Collaborative Innovation Center of Seafood Deep Processing, Dalian Polytechnic University, 116023, China) ,  Lu Jiali (College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Lu Jiali (Lamprey Research Center, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Lu Jiali (Collaborative Innovation Center of Seafood Deep Processing, Dalian Polytechnic University, 116023, China) ,  Wang Xinya (College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Wang Xinya (Collaborative Innovation Center of Seafood Deep Processing, Dalian Polytechnic University, 116023, China) ,  Pang Yue (College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Pang Yue (Lamprey Research Center, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Pang Yue (Collaborative Innovation Center of Seafood Deep Processing, Dalian Polytechnic University, 116023, China) ,  Li Qingwei (College of Life Science, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Li Qingwei (Lamprey Research Center, Liaoning Normal University, Dalian 116081, China) ,  Li Qingwei (Collaborative Innovation Center of Seafood Deep Processing, Dalian Polytechnic University, 116023, China)
資料名： Molecular Immunology  (Molecular Immunology)
巻： 117  ページ： 147-154  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0850A  ISSN： 0161-5890  CODEN： IMCHAZ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 培養過程における病原体によって感染したヤツメウナギ幼虫の多数の死亡に基づいて,異なる病原体に対するヤツメウナギ幼虫の感染応答を研究した。このように,ハイスループット配列決定は,最初に,Aeromonas hydrophila,Vitis splendidus,およびSaprolegenia parasiticaによって感染されたヤツメウナギ幼虫を分析するために使用される。338,628,426readsの高品質を得て,203,829の転写物を組み立てた。全部で158,001のUni遺伝子をBlast比較により注釈し,ヤツメウナギ幼生の比較的包括的なトランスクリプトームデータベースを確立した。3つの水生病原体によって感染したヤツメウナギ幼虫のトランスクリプトームに基づいて,COGとGOの分類結果は,シグナル伝達機構に分類された遺伝子が最大の割合を占め,2316の差別的に発現した遺伝子が同定され,スクリーニングされたことを示す。3つの病原体による感染の後,16の遺伝子と19の遺伝子発現は,それぞれ上方制御されて,下方制御された。差次的に発現した遺伝子のKEGG経路分析により,2つのグラム陰性細菌,Vibrosplendidus及びAeromonas hydrophilaによる感染後に,ヤツメウナギ幼生が主にそれらの代謝及び酸化的リン酸化経路に影響を及ぼすことを示した。菌類として,Saprolenia parasiticaは主にヤツメウナギ幼生におけるリボソーム合成に影響を及ぼした。結果を,Q-PCRを用いて病原体処理後24時間で13のDEGの発現レベルを検出することによって検証した。これらの結果は,ヤツメウナギ幼生の人工繁殖中の病原体侵入に対する免疫と自然免疫応答のさらなる研究のための価値ある情報を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *病原体 ,  ダウンレギュレーション ,  Aeromonas ,  幼虫 ,  *トランスクリプトーム ,  Aeromonas hydrophila ,  自然免疫 ,  RNA【核酸】 ,  データベース ,  *ヤツメウナギ ,  遺伝子 ,  リボソーム ,  グラム陰性菌 ,  遺伝子発現 ,  アップレギュレーション

著者キーワード (4件)： ヤツメウナギ ,  病原菌 ,  RNA-seq ,  異なる発現遺伝子

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： トランスクリプトーム解析 ,  病原体 ,  感染 ,  ヤツメウナギ ,  幼生 ,  免疫応答 ,  洞察