KAP6およびHMO1の非標準DNA結合特異性に関するin vitro研究およびKAP6のDNA結合および非結合動力学への機構的洞察【JST・京大機械翻訳】

Rajakumara Eerappa; Satish Mutyala; Abhishek Suman

文献

J-GLOBAL ID：202002264548778550 整理番号：20A1919509

KAP6およびHMO1の非標準DNA結合特異性に関するin vitro研究およびKAP6のDNA結合および非結合動力学への機構的洞察【JST・京大機械翻訳】

In vitro studies on non-canonical DNA binding specificities of KAP6 and HMO1 and mechanistic insights into DNA bound and unbinding dynamics of KAP6

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資料名：
巻： 160 ページ： 925-933 発行年： 2020年
JST資料番号： T0898A ISSN： 0141-8130 CODEN： IJBMDR 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

高移動度グループボックス(HMGB)メンバーは,ロスバスタチンに存在する様々な機能を有するDNA結合蛋白質である。様々な数のHMGボックスを有するHMGBが類似の機能を実行することができる機構はよく理解されていない。さらに,非標準DNAがHMGB蛋白質によってどのように認識されるかは明らかではない。これらに取り組むために,酵母由来のTrypanosomaおよびHigh mobility protein 1(HMO1)の2つのHMGBメンバー-Kinetoplast関連蛋白質(KAP6)を特性化するための詳細な生化学的および計算研究を行った。ここでは,KAP6がB型DNAより非標準DNAsタイトに結合することを報告する。非標準DNAsの中で,KAP6は産卵およびフラップ構造に対して最も高い親和性を有したが,Holliday Junction(HJ)に対しては最小であった。対照的に,HMO1はHJと堅固に結合する。コンピュータ分析は,DNA相互作用に関与する二次構造要素がHMGBメンバーKAP6とミトコンドリア転写因子Aで保存されていることを示した。シミュレーション分析は,KAP6 HMGボックスにより誘導されるDNAのΔΨ90°屈曲が,蛋白質のHelix 1とHelix 2による2つのΔΨ45°ベンドの結果であることを明らかにした。我々のデータは,HMO1とKAP6のオーソログが溶液中でオリゴマーであり,DNAの屈曲やループ形成などの機能に必要であることを示唆する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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生物学的機能 , 分子構造 , 遺伝子発現

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