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J-GLOBAL ID：202002264791939532   整理番号：20A1083922

Pumilio仲介mRNA崩壊の標的の系統的解析はDNA損傷によるPUM1抑制がトランス損傷合成を活性化することを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Systematic Analysis of Targets of Pumilio-Mediated mRNA Decay Reveals that PUM1 Repression by DNA Damage Activates Translesion Synthesis

著者 (8件)： Yamada Toshimichi (Meiji Pharmaceutical University, Kiyose-shi, Tokyo 204-8588, Japan) ,  Imamachi Naoto (Isotope Science Center, The University of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0032, Japan) ,  Imamura Katsutoshi (Isotope Science Center, The University of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0032, Japan) ,  Taniue Kenzui (Isotope Science Center, The University of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0032, Japan) ,  Kawamura Takeshi (Isotope Science Center, The University of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0032, Japan) ,  Suzuki Yutaka (Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Sciences, The University of Tokyo, Kashiwa-shi, Chiba 277-8562, Japan) ,  Nagahama Masami (Meiji Pharmaceutical University, Kiyose-shi, Tokyo 204-8588, Japan) ,  Akimitsu Nobuyoshi (Isotope Science Center, The University of Tokyo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0032, Japan)
資料名： Cell Reports  (Cell Reports)
巻： 31  号： 5  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3124A  ISSN： 2211-1247  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA結合蛋白質(RBP)は転写物の安定性を調節することにより遺伝子発現において中心的役割を果たす。しかしながら,RBPの分解標的mRNAの同定は困難である。トランスクリプトーム-ワイドmRNA安定性とmRNAのヒトPumilio1(PUM1)への結合の組合せ分析により,両方ともPUM1に結合し,PUM1依存性分解を示す48のmRNAを同定した。RNA-seqデータにおけるPUM1の存在量とその分解標的mRNAの変化の分析は,DNA損傷剤がPUM1仲介mRNA崩壊を負に調節することを示す。シスプラチンに曝露された細胞は,PUM1量を減少させ,経病変合成(TLS)によるDNA損傷耐性に関与する蛋白質をコードするPCNAおよびUBE2A mRNAを増加させた。PUM1を過剰発現する細胞はDNA合成とTLSの障害を示し,シスプラチンの細胞毒性効果に対する感受性を増加させた。このように,この方法はPUM1仲介減衰の標的mRNAを同定し,細胞がTLS1仲介mRNA崩壊を阻害することにより,TLSを活性化することによりDNA損傷に応答することを明らかにした。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA合成 ,  *RNA【核酸】 ,  *mRNA ,  ヒト ,  細胞毒性 ,  遺伝子発現 ,  *DNA損傷 ,  トランスクリプトーム ,  RNA結合タンパク質 ,  *mRNA分解 ,  過剰発現 ,  mRNA安定性 ,  RNA-seq ,  白金錯体 ,  抗腫瘍薬 ,  アンミン錯体 ,  クロロ錯体 ,  分子遺伝現象
準シソーラス用語： シスプラチン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： RNA結合蛋白質 ,  Pumilio ,  RNA安定性 ,  RNA-seq ,  RIP-seq ,  BRIC-seq ,  in silicoスクリーニング ,  DNA損傷 ,  経病変合成

分類 (4件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (9件)： 仲介 ,  mRNA崩壊 ,  標的 ,  系統 ,  解析 ,  DNA損傷 ,  トランス ,  損傷 ,  活性化