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J-GLOBAL ID：202002265313596136   整理番号：20A2511962

北西ヒマラヤのインゲンマメ:ゲノムワイド関連研究を通した定量的炭疽病抵抗性の個体群構造とマッピング【JST・京大機械翻訳】

North-Western Himalayan Common Beans: Population Structure and Mapping of Quantitative Anthracnose Resistance Through Genome Wide Association Study

著者 (11件)： Banoo Aqleema (Plant Virology and Molecular Plant Pathology Laboratory, Division of Plant Pathology, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India) ,  Nabi Asha (Directorate of Extension, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India) ,  Rasool Rovidha S. (Plant Virology and Molecular Plant Pathology Laboratory, Division of Plant Pathology, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India) ,  Mahiya-Farooq (Plant Virology and Molecular Plant Pathology Laboratory, Division of Plant Pathology, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India) ,  Shah Mehraj D. (Plant Virology and Molecular Plant Pathology Laboratory, Division of Plant Pathology, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India) ,  Ahmad Mushtaq (Directorate of Extension, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India) ,  Sofi Parvaze A. (Division of Genetics and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, SKUAST-Kashmir, Wadura, India) ,  Aasiya-Nabi (Plant Virology and Molecular Plant Pathology Laboratory, Division of Plant Pathology, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India) ,  Itoo Hamidullah (Ambri Apple Research Centre, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India) ,  Sharma P. N. (Department of Plant Pathology, CSK HPKV, Palampur, India) ,  Padder Bilal A. (Plant Virology and Molecular Plant Pathology Laboratory, Division of Plant Pathology, SKUAST-Kashmir, Srinagar, India)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 11  ページ： 571618  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： インゲンマメ(Phaseolus vulgaris L.)は,北西(NW)ヒマラヤ地域の重要なマメ科作物であり,作物に壊滅的な損失を引き起こす主要な病気は炭疽病であり,これはColletotrichum lindemuthanumによって引き起こされる。病原体は高度に多様であり,大部分の市販品種は,地域で流行する異なる品種に感受性である。北西ヒマラヤのインゲンマメ集団における炭疽病耐性に関連するゲノム領域に関する情報の欠如は,主要な炭疽病種に対する量的耐性Loci(QRLs)を解離させた。本研究では,NW地域から採取した188のインゲンマメ在来種を5つの重要な炭疽病種に対してスクリーニングし,113の豆遺伝子型は1つまたは複数の人種に対する耐性を示した。配列決定による遺伝子型決定(GBS)を192の豆系統(4つの対照+188のインド豆)のパネルで実施し,22,589のSNPを得た。192のマメ遺伝子型の個体群構造解析は,188のインドの豆を,明らかな混和物を有するアンデスとメソアメリアの遺伝子プールを代表する2つの主要なクラスタに分類した。インドのC.lindemuthanum毒性(レース3,87,および503)に対する炭疽病耐性に関連する多くのQRLは,典型的な耐性遺伝子シグネチャをコードする遺伝子モデル内のPv04に位置する。レース73に関連するQRLはPv08に位置し,Co-4炭疽病耐性遺伝子と重複する。典型的なNB-ARCドメインを有するLRRをコードする遺伝子モデルPhvul.011G202300におけるPv11の遠位端に位置するSNPは,レース73耐性との関連を示した。Pv03,Pv09,およびPv11に位置するインゲンマメゲノム領域は,炭疽病レース2047に対する耐性との関連を示した。本研究は,炭疽病耐性に関連する多くの新規豆ゲノム領域の存在を示した。本材料におけるCo-4およびCo-2遺伝子の存在は,この地域に対して耐性のある炭疽病耐性品種を育種するのに有望である。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農作物 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  *インゲンマメ ,  *ゲノム ,  マメ科 ,  クラスタ ,  品種 ,  病原体 ,  Colletotrichum ,  在来種 ,  量的形質遺伝子座
準シソーラス用語： *個体群構造 ,  耐性遺伝子 ,  遺伝子タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： インゲンマメ ,  SNP ,  ゲノムワイド関連研究 ,  炭疽病抵抗性 ,  量的形質遺伝子座 ,  北西ヒマラヤ豆

分類 (2件)： 豆類  (FC03035U) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y)

引用文献 (119件)：

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• BeaverJ. S.RosasJ. C.MyersJ.AcostaJ.KellyJ. D.Nchimbi-MsollaS.. (2003). Contributions of the Bean/Cowpea CRSP to Cultivar and Germplasm Development in Common Bean. Field Crops Res. 82, 87-102. doi: doi: 10.1016/S0378-4290(03)00032-7

タイトルに関連する用語 (9件)： ヒマラヤ ,  インゲンマメ ,  ゲノム ,  研究 ,  定量 ,  炭疽病 ,  抵抗性 ,  個体群構造 ,  マッピング