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J-GLOBAL ID：202002265623339461   整理番号：20A2603814

WGCNAによるキャベツ型アブラナの低温ストレスに対する遺伝子共発現ネットワークを同定した。【JST・京大機械翻訳】

Identification of co-expression networks responding to low-temperature stress by WGCNA in Brassica napus L.

著者 (7件)： Qin Mengfan (西北農林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点実験室/農学院,陜西楊凌,712100) ,  Li Haodong (西北農林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点実験室/農学院,陜西楊凌,712100) ,  Zuo Kaifeng (西北農林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点実験室/農学院,陜西楊凌,712100) ,  Guo Na (西北農林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点実験室/農学院,陜西楊凌,712100) ,  Xu Yu (西北農林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点実験室/農学院,陜西楊凌,712100) ,  Huang Zhen (西北農林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点実験室/農学院,陜西楊凌,712100) ,  Xu Aixia (西北農林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点実験室/農学院,陜西楊凌,712100)
資料名： Zhongguo Youliao Zuowu Xuebao  (Zhongguo Youliao Zuowu Xuebao)
巻： 42  号： 4  ページ： 554-562  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2270A  ISSN： 1007-9084  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： キャベツ型アブラナの低温ストレス時の共発現ネットワークを知るために、加重遺伝子共発現ネットワーク分析(weightedgeneco-expres-sionnetworkanalysis,WGCNA)方法を用いた。HX17とHX58の異なる低温処理による36のRNA-seqデータを,2つの耐凍性応答の差のあるキャベツ型アブラナ材料(HX17とHX58)を用いて,WGCNA分析のために,低発現遺伝子をフィルタリングすることによってスクリーニングした。16の遺伝子共発現モジュールを同定した。転写因子予測、冷関連遺伝子予測、モジュール遺伝子のgeneontology(GO)の濃縮及び発現分析を結びつけ、brownモジュールが凍害ストレスに応答する共通モジュール、pinkモジュールがHX17耐寒性特異的モジュールであることを同定した。また、遺伝子共発現ネットワークを構築し、アブラナの耐寒性/抗凍結メカニズムの研究に新たな根拠を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  *キャベツ ,  フィルタリング ,  *遺伝子 ,  耐寒性 ,  耐凍性 ,  凍結防止 ,  *アブラナ ,  凍害 ,  *寒冷ストレス ,  転写因子
準シソーラス用語： ネットワーク解析 ,  *共発現 ,  低温処理 ,  RNA-seq , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 油料作物  (FC03074V) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： キャベツ ,  アブラナ ,  低温ストレス ,  遺伝子 ,  共発現 ,  同定