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J-GLOBAL ID：202002265767154219   整理番号：20A1687514

アンサンブルサポートベクトルマシンによる多重配列特徴の統合による2-ヒドロキシイソブチリル化部位の予測【JST・京大機械翻訳】

Prediction of 2-hydroxyisobutyrylation sites by integrating multiple sequence features with ensemble support vector machine

著者 (2件)： Ju Zhe (College of Science, Shenyang Aerospace University, 110136, People’s Republic of China) ,  Wang Shi-Yun (College of Science, Shenyang Aerospace University, 110136, People’s Republic of China)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 87  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： リジン2-ヒドロキシイソブチリル化(K_hib)はヒストン標識の新しいタイプであり,ヒストンとDNAの間の関連に影響することが見出されている。K_hibの分子機構をより良く理解するためには,2-ヒドロキシイソブチリル化基質とそれらの対応するK_hib部位を正確に同定することが重要である。本研究では,ヒトHeLa細胞におけるK_hib部位を予測するために,KhibPredと名付けた新規バイオインフォマティクスツールを提案した。K_hib部位をコードするために,3種類の有効特性,k-空間アミノ酸対の組成,二成分符号化およびアミノ酸因子を組み込んだ。さらに,アンサンブルサポートベクトルマシンを用いて予測における不均衡問題を克服した。10倍の交差検証によって例証されるように,KhibPredの性能は,0.7937の受信者動作特性曲線の下の面積で満足な性能を達成した。したがって,KhibPredは蛋白質K_hib部位を予測するための有用なツールである。特徴解析は,極性因子特性がK_hibサイトの予測において顕著な役割を果たすことを示した。本研究から得られた結論は,K_hibの分子機構への詳細な調査のための有用な洞察を提供するであろう。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 特徴抽出 ,  アミノ酸 ,  DNA【核酸】 ,  HeLa細胞 ,  基質 ,  タンパク質 ,  ヒストン ,  ヒト ,  *多重化 ,  *サポートベクトルマシン ,  翻訳後修飾
準シソーラス用語： ROC曲線 ,  不均衡 ,  分子機構 ,  特徴解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 翻訳後修飾 ,  2-ヒドロキシイソブチリル化 ,  特徴抽出 ,  アンサンブルサポートベクトルマシン

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： アンサンブル ,  サポートベクトルマシン ,  多重 ,  統合 ,  予測