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J-GLOBAL ID:202002265888660667   整理番号:20A2206651

AbaR型ゲノムアイランドの比較分析は異なる骨格を持つ要素における遺伝的特徴の異なるパターンを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative Analysis of AbaR-Type Genomic Islands Reveals Distinct Patterns of Genetic Features in Elements with Different Backbones
著者 (8件):
資料名:
巻:号:ページ: Null  発行年: 2020年 
JST資料番号: W5747A  ISSN: 2379-5042  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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ABSTRACT AbaR型ゲノム島(AbaRs)は,Acinetobacter baumanniiにおける多重抗菌剤耐性と関連する。AbaRsは,多様な移動性遺伝要素(MGEs)および抗菌耐性遺伝子の獲得と,異なるが密接に関連する骨格を含む構造構成を変化させた。本研究は,AbaRsの構造変調パターンを理解することを目的とした。非耐性だが密接に関連する島を含む全部で442の無傷AbaRsを,骨格Tn6019,Tn6022,Tn6172/Tn6173およびAbGRI1-0にマッピングし,続いて外来配列特性化を行った。次に,遺伝的構成を調べ比較した。AbaRsは53の遺伝子構成に陥り,そのうち26は新規で,1つのTn6019型,9つのTn6022型,3つのTn6172/Tn6173型,9つのAbGRI1型,および既知の骨格にマッピングできない4つの新規トランスポゾンを含んだ。。”その間”は,1つのTn6019型,9個のTn6022型,3個のTn6172/Tn6173型,9個のAbGRI1型,および4個の新規トランスポゾンを含んでいた。新たに同定された遺伝的構成は,ISAcsp2,ISAba42,ISAba17,およびISAba10のような新規MGEsの挿入,ISCR2,Tn2006,および別のAbaRなどの既知のMGEsにより駆動される新規構造変調,および異なる骨格欠失を含む。AbGRI1型要素における組換え事象も,異なる骨格からハイブリッド配列を同定することによって調べた。さらに,著者らは,これらの要素の可塑性を駆動するMGEsのプロファイルを含むAbaRsの内容と文脈の特徴と,その結果として得られた抗菌耐性遺伝子,挿入部位,およびクローン分布が,骨格特異的パターンを示すことを見出した。本研究はAbaRsの遺伝的特徴の包括的見解を提供する。IMPORTANCE AbaR型ゲノム島(AbaRs)は,Acinetobacter baumanniiにおいて抗菌剤耐性を引き起こすことができるよく知られた要素である。これらの要素は,多様な移動性遺伝要素と抗菌耐性遺伝子の獲得を有する異なるが関連する骨格を含む多様で複雑な遺伝的構成を含む。それらの構造多様性を理解することは,完全には遠い。本研究では,非耐性だが密接に関連した島を含むAbaRsの大規模比較解析を行った。著者らの知見は,それらの遺伝的特徴の包括的で興味深い見解を提供し,これらの要素の骨格型への宿主クローン分布と同様に,構造変調シグネチャ,抗菌耐性パターン,挿入遺伝子座を相関させることができた。本研究は,これらの要素の進化への洞察を提供し,それらの抗菌耐性遺伝子プロファイルとクローン分布の間の関連を説明し,様々な使用の用語「AbaR」よりもより適切な命名の確立を容易にすることができた。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
微生物生理一般  ,  遺伝子の構造と化学 
タイトルに関連する用語 (5件):
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