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J-GLOBAL ID：202002266109834246   整理番号：20A0774876

稀なヒト前立腺基底細胞癌の変異およびトランスクリプトーム景観【JST・京大機械翻訳】

Mutational and transcriptomic landscapes of a rare human prostate basal cell carcinoma

著者 (20件)： Su Xianbin (Department of Urology and Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education), Renji Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Su Xianbin (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Long Qi (Key Laboratory for Regenerative Medicine (Ministry of Education), School of Biomedical Sciences, Faculty of Medicine, The Chinese University of Hong Kong, Hong Kong SAR, China) ,  Bo Juanjie (Department of Urology and Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education), Renji Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Shi Yi (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Zhao Li-Nan (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Lin Yingxin (Department of Statistics, Charles Perkins Center and School of Mathematics and Statistics, The University of Sydney, Sydney, Australia) ,  Luo Qing (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Ghazanfar Shila (Department of Statistics, Charles Perkins Center and School of Mathematics and Statistics, The University of Sydney, Sydney, Australia) ,  Ghazanfar Shila (Cancer Research UK Cambridge Institute, Li Ka Shing Centre, University of Cambridge, Cambridge, UK) ,  Zhang Chao (Department of Urology, Shanghai Changhai Hospital, Second Military Medical University, Shanghai, China) ,  Liu Qiang (Department of Pathology, Renji Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Wang Lan (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  He Kunyan (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  He Jian (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Cui Xiaofang (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Yang Jean Y. H. (Department of Statistics, Charles Perkins Center and School of Mathematics and Statistics, The University of Sydney, Sydney, Australia) ,  Han Ze-Guang (Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education) and Collaborative Innovation Center of Systems Biomedicine, Shanghai Center for Systems Biomedicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Yang Guoliang (Department of Urology and Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education), Renji Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China) ,  Sha Jian-jun (Department of Urology and Key Laboratory of Systems Biomedicine (Ministry of Education), Renji Hospital, School of Medicine, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China)
資料名： Prostate  (Prostate)
巻： 80  号： 6  ページ： 508-517  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0088A  ISSN： 0270-4137  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:前立腺癌の稀なサブタイプとして,基底細胞癌(BCC)は広く研究されておらず,系統的な分子特性化を欠いている。方法:ここでは,ヒト前立腺BCC(CK34βE12+/P63+/PAP-/PSA-)の試料に単一細胞ゲノム増幅とRNA-Seqを適用した。突然変異景観は,49の単一細胞の増幅混合物の全体のexome配列決定を通して得て,69の単一細胞のトランスクリプトームも得た。【結果】BCCで突然変異した5つの推定駆動遺伝子は,CASC5,NUTM1,PTPRC,KMT2CおよびTBX3であり,上部3ヌクレオチド置換は,一般的前立腺癌と同様に,C>T,T>CおよびC>Aであった。変異体対立遺伝子頻度値の分布は,これらの単一細胞が同じ腫瘍クローンからであることを示した。69の単一細胞は,それらのグローバルなトランスクリプトームプロファイルに基づいて,腫瘍,間質,および免疫細胞にクラスタ化された。腫瘍細胞は,KRT5,KRT14およびKRT23および上皮マーカーEPCAM,CDH1およびCD24のような基底細胞マーカーを特異的に発現する。転写因子共分散ネットワーク分析は,BCC腫瘍細胞が異なる調節ネットワークを有することを示した。現在の前立腺癌データセットとの比較により,いくつかのバルク試料が基底細胞特徴を示すことを見出した。興味深いことに,単一細胞解像度では,前立腺BCC腫瘍細胞の遺伝子発現パターンは,通常の前立腺癌由来循環腫瘍細胞のそれと比較して特異性を示す。結論:本研究は,初めて前立腺BCCの包括的な突然変異とトランスクリプトームの景観を明らかにし,それはその腫瘍形成機構の理解の基礎を築き,一般的に前立腺癌への新しい洞察を提供する。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 腫瘍細胞 ,  上皮 ,  *前立腺 ,  クローン ,  突然変異 ,  腫瘍 ,  前立腺腫瘍 ,  転写因子 ,  *トランスクリプトーム ,  *ヒト ,  遺伝子発現 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  クラスタ化 ,  腫瘤形成

著者キーワード (6件)： 基底細胞癌 ,  遺伝子発現 ,  突然変異 ,  前立腺 ,  単一細胞配列決定 ,  転写因子

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒト ,  前立腺 ,  基底細胞癌 ,  変異 ,  トランスクリプトーム ,  景観