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J-GLOBAL ID：202002266260345391   整理番号：20A2634498

三重RNA-Seqはヒトウイルス-真菌共感染モデルにおける相乗作用を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Triple RNA-Seq Reveals Synergy in a Human Virus-Fungus Co-infection Model

著者 (25件)： Seelbinder Bastian (Systems Biology and Bioinformatics, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology - Hans Knoll Institute (HKI), 07745 Jena, Germany) ,  Wallstabe Julia (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Marischen Lothar (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Weiss Esther (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Wurster Sebastian (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Wurster Sebastian (The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Department of Infectious Diseases, Infection Control and Employee Health, Houston, TX 77030, USA) ,  Page Lukas (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Loffler Claudia (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Bussemer Lydia (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Schmitt Anna-Lena (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Wolf Thomas (Systems Biology and Bioinformatics, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology - Hans Knoll Institute (HKI), 07745 Jena, Germany) ,  Linde Jorg (Friedrich-Loeffler-Institut, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Bacterial Infections and Zoonoses, 07743 Jena, Germany) ,  Cicin-Sain Luka (Department of Vaccinology and Applied Microbiology, Helmholtz Centre for Infection Research, Hannover-Braunschweig Site, 38124 Braunschweig, Germany) ,  Cicin-Sain Luka (Cluster of Excellence RESIST (EXC 2155), Hannover Medical School (MHH) Braunschweig, 38124 Braunschweig, Germany) ,  Becker Jennifer (Institute for Experimental Infection Research, TWINCORE-Centre for Experimental and Clinical Infection Research, a joint venture between the Hannover Medical School and the Helmholtz Centre for Infection Research, Cluster of Excellence RESIST (EXC 2155), Hannover Medical School (MHH), 306...) ,  Kalinke Ulrich (Institute for Experimental Infection Research, TWINCORE-Centre for Experimental and Clinical Infection Research, a joint venture between the Hannover Medical School and the Helmholtz Centre for Infection Research, Cluster of Excellence RESIST (EXC 2155), Hannover Medical School (MHH), 306...) ,  Vogel Jorg (Institute of Molecular Infection Biology (IMIB), University of Wuerzburg, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Vogel Jorg (Helmholtz Institute for RNA-based Infection Research (HIRI), Helmholtz Centre for Infection Research (HZI), 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Panagiotou Gianni (Systems Biology and Bioinformatics, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology - Hans Knoll Institute (HKI), 07745 Jena, Germany) ,  Panagiotou Gianni (Department of Medicine and State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, University of Hong Kong, Hong Kong S.A.R., China) ,  Einsele Hermann (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Westermann Alexander J. (Institute of Molecular Infection Biology (IMIB), University of Wuerzburg, 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Westermann Alexander J. (Helmholtz Institute for RNA-based Infection Research (HIRI), Helmholtz Centre for Infection Research (HZI), 97080 Wuerzburg, Germany) ,  Schaeuble Sascha (Systems Biology and Bioinformatics, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology - Hans Knoll Institute (HKI), 07745 Jena, Germany) ,  Loeffler Juergen (University Hospital Wuerzburg, Medical Hospital II, WUE4i, 97080 Wuerzburg, Germany)
資料名： Cell Reports  (Cell Reports)
巻： 33  号： 7  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3124A  ISSN： 2211-1247  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ハイスループットRNA配列決定(RNA-seq)は,多様な生物学的過程を研究するために日常的に適用されている。しかし,相互作用生物上で別々に実行されるとき,RNA抽出,ライブラリー調製,および配列決定に固有の全身性ノイズは,交差種相互作用ノードの同定を妨げる。ここでは,しばしば共存する肺病原体Aspergillus fumigatusおよびヒトサイトメガロウイルス(CMV)に感染した単球由来樹状細胞(moDC)のトランスクリプトームを同時に検出する三重RNA-seqを開発した。単一感染後のそれらと共感染後の発現パターンを比較し,著者らのデータは2つの病原体に対する宿主応答間の相乗効果と相互干渉を明らかにした。例えば,CMVは,NF-κB(核因子κB)とNFAT(活性化T細胞の核因子)カスケードを介して炎症促進性サイトカインの真菌媒介活性化を減弱し,一方,A.fumigatusはI型インターフェロンシグナル伝達のウイルス核酸誘導活性化を打ち消すことによりウイルスクリアランスを障害する。併せて,三重RNA-seqの分析力は,真菌/ウイルス単一感染または共感染に対する異なるmoDC応答における分子ハブを提案し,病因の理解および移植後感染のクリアランスに寄与する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 雑音 ,  相互作用 ,  *RNA【核酸】 ,  炎症 ,  *相乗作用 ,  *真菌類 ,  Aspergillus ,  病原体 ,  サイトメガロウイルス ,  Aspergillus fumigatus ,  樹状細胞 ,  サイトカイン ,  病因 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： 樹状細胞 ,  Aspergillus ,  サイトメガロウイルス ,  肺感染症 ,  種間相互作用 ,  宿主応答 ,  転写ネットワーク ,  相乗作用 ,  三重RNA-seq

分類 (3件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 三重 ,  RNA-seq ,  ヒト ,  ウイルス ,  真菌 ,  感染モデル ,  相乗作用