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J-GLOBAL ID:202002266485211967   整理番号:20A0793355

絡み合った蛋白質の折畳みについて: ノット,Lassos,リンクおよびθ曲線【JST・京大機械翻訳】

On folding of entangled proteins: knots, lassos, links and θ-curves
著者 (2件):
資料名:
巻: 60  ページ: 131-141  発行年: 2020年 
JST資料番号: A1162A  ISSN: 0959-440X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 文献レビュー  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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PDB中に堆積した蛋白質構造の約6%はもつれており,ノット,滑り,ラッソス,リンク,およびθ曲線を形成している。これらのケースの各々において,蛋白質骨格は複雑な方法でそれ自身を通して織り,いくつかの点は蛋白質構造の他の領域によって形成された閉鎖ループを通過する。このような通過はトポロジー障壁を横切ると解釈できる。蛋白質がそのような障壁をどのように克服するか,それ故に異なる程度のフラストレーション,挑戦された科学者,及び蛋白質折畳みの分野に新しい光を当てた。本レビューでは,非自明トポロジーを持つ蛋白質の自由エネルギー景観に関する現在の知識を要約した。著者らは,蛋白質を自己結合に導く同定された機構を記述する。著者らは,利用可能なデータに基づいて,さつdingやシャペロンのような排除された体積の影響について議論する。蛋白質のトポロジー的複雑性の多様性とそれらの進化について簡単に考察した。また,非自明なトポロジーを調べるために利用可能なツールをリストアップした。最後に,生物物理学,生物情報学,生物学,及び数学の境界における興味ある挑戦的な疑問を定式化し,それはもつれ蛋白質の発見から生じる。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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