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J-GLOBAL ID：202002266496564799   整理番号：20A0786749

Lytechinus variegatusに対する発生トランスクリプトームは一時的に切断された遺伝子発現変化を示す【JST・京大機械翻訳】

The developmental transcriptome for Lytechinus variegatus exhibits temporally punctuated gene expression changes

著者 (22件)： Hogan John D. (Program in Bioinformatics, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Keenan Jessica L. (Program in Bioinformatics, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Luo Lingqi (Program in Bioinformatics, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Ibn-Salem Jonas (Evolution and Development Group, Max-Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany) ,  Ibn-Salem Jonas (Faculty of Biology, Johannes Gutenberg University of Mainz, Mainz, Germany) ,  Lamba Arjun (Biology Department, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Schatzberg Daphne (Biology Department, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Piacentino Michael L. (Program in Molecular and Cellular Biology and Biochemistry, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Zuch Daniel T. (Program in Molecular and Cellular Biology and Biochemistry, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Core Amanda B. (Biology Department, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Blumberg Carolyn (Biology Department, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Timmermann Bernd (Sequencing Core Facility, Max-Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany) ,  Grau Jose Horacio (Dahlem Centre for Genome Research and Medical Systems Biology, Environmental and Phylogenomics Group, Berlin, Germany) ,  Grau Jose Horacio (Museum fuer Naturkunde Berlin, Leibniz-Institut fuer Evolutions- und Biodiversitaetsforschung, Berlin, Germany) ,  Speranza Emily (Program in Bioinformatics, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Andrade-Navarro Miguel A. (Faculty of Biology, Johannes Gutenberg University of Mainz, Mainz, Germany) ,  Irie Naoki (Department of Biological Sciences, University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Poustka Albert J. (Evolution and Development Group, Max-Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany) ,  Poustka Albert J. (Dahlem Centre for Genome Research and Medical Systems Biology, Environmental and Phylogenomics Group, Berlin, Germany) ,  Bradham Cynthia A. (Program in Bioinformatics, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Bradham Cynthia A. (Biology Department, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Bradham Cynthia A. (Program in Molecular and Cellular Biology and Biochemistry, Boston University, Boston, MA, USA)
資料名： Developmental Biology  (Developmental Biology)
巻： 460  号： 2  ページ： 139-154  発行年： 2020年 
JST資料番号： C0522A  ISSN： 0012-1606  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 胚発生は最も複雑な過程であり,生物はその寿命中に起こり,この複雑さを理解することはシステムレベルの視点で最も良くアプローチされる。ウニは,発生的仕様,形態形成および進化を理解するための非常に価値のあるモデル生物になっている。非脊索動物重水素症として,ウニは原生動物と脊椎動物の間の重要な進化的ニッチを占める。Lytechinus variegatus(Lv)は,よく研究されている大西洋種であり,胚および幼生発生時のシグナル伝達,パターン形成および形態形成変化に重要な洞察を提供している。太平洋種,Strongylocentrotus purpuratus(Sp)は,特に遺伝子調節ネットワーク(GRN)およびcis-調節分析に対して,もう一つの良く研究されたウニである。Spに対する良く注釈されたゲノムとトランスクリプトームは利用可能であるが,類似の資源はLvに対して開発されていない。ここでは,胚および幼生発生時の11の時点におけるLvトランスクリプトームの分析を提供する。時間的分析は,特定化の基礎となる遺伝子調節ネットワークがウニ種間で良く保存されていることを示唆する。著者らは,胚の転写の変化における主要な遷移が,発生時系列を4つの異なる,時間的に連続した相に分割することを示す。著者らの研究は,ウニ発生が突然の遷移によって中断される比較的安定な遺伝子発現状態の連続的な間隔を介して起こることを示している。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 原生動物 ,  RNA【核酸】 ,  脊椎動物 ,  胚発生 ,  ゲノム ,  形態形成 ,  大西洋 ,  *Lytechinus ,  *遺伝子発現 ,  細胞情報伝達 ,  パターン形成 ,  リバモリウム ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *Lytechinus variegatus ,  遺伝子調節ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ウニ ,  主成分分析 ,  遺伝子調節ネットワーク ,  RNA-seq

分類 (2件)： 発生と分化  (EJ16020W) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： Lytechinus ,  トランスクリプトーム ,  遺伝子発現