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J-GLOBAL ID:202002266980362894   整理番号:20A2163820

ヒト腫瘍関連カルシウムシグナル伝達因子2のバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatic analysis of the structure and function of human TACSTD2
著者 (4件):
資料名:
巻: 33  号:ページ: 570-576  発行年: 2020年 
JST資料番号: C3037A  ISSN: 1008-8199  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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目的:ヒト腫瘍関連カルシウムシグナル伝達因子2(TACSTD2)の腫瘍形成過程における癌促進作用はますます重視されている。バイオインフォマティクス法を用いてTACSTD2の分子構造と生物学的機能を予測し、TACSTD2の機能研究に参考を提供する。【方法】ヒト由来TACSTD2遺伝子のmRNAと蛋白質アミノ酸配列を得て,TACSTD2蛋白質のオープンリーディングフレーム(ORF),物理化学的特性,シグナルペプチド,および細胞内局在をバイオインフォマティクス分析で分析し,TACSTD2蛋白質の膜貫通構造,二次構造,およびTACSTD2蛋白質を予測した。三級構造、ドメイン、タンパク質修飾部位、最後にTACSTD2タンパクの相互作タンパク質を予測し、関連する経路分析、及びTACSTD2のヒト異なる正常組織と腫瘍組織におけるmRNAとタンパク発現レベルを予測した。結果:TACSTD2のmRNA配列から得られたORFは12個で、最長のORFはORF1であり、972bpで、323個のアミノ酸をコーディングできる。TACSTD2タンパクの親水性のアミノ酸は疎水性のアミノ酸より多いため、TACSTD2タンパク質は親水性タンパク質に属することが明らかになった。TACSTD2は高度に保存された塩基性分泌タンパク質であり、細胞質内外に膜貫通領域がある。TACSTD2のアミノ酸配列は核定位シグナル(nuclearlocalizationsignal,NLS)が存在し、TACSTD2は細胞核に定位できることを示唆した。TACSTD2タンパク質は主に細胞質膜、細胞外、細胞核及び細胞質に分布している。二次構造予測の結果、TACSTD2タンパクは主に環状構造であり、その次は螺旋構造であった。TACSTD2蛋白質は15個のセリン修飾部位、17個のトレオニン修飾部位、8個のチロシン修飾部位を有する。TACSTD2はClaudin(CLDN)ファミリー蛋白質と相互作用する。TACSTD2は以下のシグナル伝達経路に参与する:細胞表面受容体シグナル伝達経路、視覚感知細胞増殖、上皮細胞移動の負の調節、上皮細胞の増殖の調節、刺激に対する反応など。正常組織と比較して,TACSTD2のmRNAは,子宮頚癌,肺癌,甲状腺癌,子宮癌,肝臓癌,結腸直腸癌の中等度腫瘍組織で高発現した。結論:TACSTD2は多種の悪性腫瘍で高発現し、細胞表面受容体シグナルを通じて悪性腫瘍細胞の増殖、移動、粘着などの過程に関与し、TACSTD2の機能を更に研究するために参考を提供する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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JSTが定めた文献の分類名称とコードです
腫ようの化学・生化学・病理学  ,  消化器の腫よう 

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