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J-GLOBAL ID：202002267651090335   整理番号：20A0708078

農業科学へのトランスポゾン挿入配列決定の応用【JST・京大機械翻訳】

Application of Transposon Insertion Sequencing to Agricultural Science

著者 (6件)： Fabian Belinda K. (ARC Centre of Excellence in Synthetic Biology, Macquarie University, Sydney, NSW, Australia) ,  Fabian Belinda K. (Department of Molecular Sciences, Macquarie University, Sydney, NSW, Australia) ,  Tetu Sasha G. (ARC Centre of Excellence in Synthetic Biology, Macquarie University, Sydney, NSW, Australia) ,  Tetu Sasha G. (Department of Molecular Sciences, Macquarie University, Sydney, NSW, Australia) ,  Paulsen Ian T. (ARC Centre of Excellence in Synthetic Biology, Macquarie University, Sydney, NSW, Australia) ,  Paulsen Ian T. (Department of Molecular Sciences, Macquarie University, Sydney, NSW, Australia)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 11  ページ： 291  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの植物関連細菌は植物成長に積極的に影響する能力を有し,農薬と肥料に対する依存性を低減するために,農業環境におけるそのような細菌の利用に関心が高まっている。しかし,この方法で微生物を利用する能力は,分子レベルでの細菌-植物相互作用のパターン理解により現在制限されている。分子相互作用を研究する従来の方法は,時間における1つの遺伝子の機能を特性化することを求めてきたが,本研究の遅いペースは,大部分の細菌遺伝子の機能が不明のままであるか,あまり理解されていないことを意味する。農業システムにおける細菌遺伝子の機能への研究を改善し,スピードアップするための新しいアプローチは,微生物コミュニティを最適化し,マイクロビーズベースの製品を開発するための努力を促進するであろう。トランスポゾン挿入配列解析のようなハイスループット遺伝子機能解析を可能にする技術は,植物-細菌相互作用の重要な側面を決定するために広く適用される可能性がある。トランスポゾン挿入配列決定は,細菌ゲノムにおけるすべての非必須遺伝子の機能を同時に調べるために,飽和トランスポゾン変異誘発とハイスループット配列決定を組み合わせる。この技術は,微生物-植物相互作用,ストレス耐性および病原体毒性に関与する遺伝子を同定するために,in vitroおよびin vivo研究の両方に用いることができる。そのような研究により提供された情報は細菌遺伝子機能決定の速度を急速に加速し,農業関連細菌の生物相互作用,代謝及び生存の基礎となる遺伝子及び経路への洞察を提供するであろう。この知識は,特定の条件,作物接種剤の処方,または作物保護製品の開発のために,最も適切な植物成長促進細菌を選択するために使用できる。このレビューは,トランスポゾン挿入配列決定の概観を提供し,このアプローチが植物関連細菌の研究にどのように適用されたかを概説し,農業の利益に対するこれらの技術の新しい応用を提案する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農薬 ,  分子間相互作用 ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  生物相互作用 ,  接種剤 ,  病原体 ,  植物成長 ,  遺伝子 ,  最適化 ,  微生物 ,  細菌 ,  *挿入配列 ,  *トランスポゾン ,  農作物 ,  in vitro実験

著者キーワード (7件)： 生物防除 ,  植物成長促進細菌 ,  肥料 ,  ミクロビオーム ,  農薬 ,  トランスポゾン挿入配列決定 ,  トランスポゾン変異誘発

分類 (1件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A)

引用文献 (114件)：

• Ali S. Z., Sandhya V., Grover M., Linga V. R., Bandi V. (2011). Effect of inoculation with a thermotolerant plant growth promoting Pseudomonas putida strain AKMP7 on growth of wheat (Triticum spp.) under heat stress. J. Plant Interact. 6 239-246. doi: 10.1080/17429145.2010.545147
• Arkhipova T., Galimsyanova N., Kuzmina L., Vysotskaya L., Sidorova L., Gabbasova I., et al (2019). Effect of seed bacterization with plant growth-promoting bacteria on wheat productivity and phosphorus mobility in the rhizosphere. Plant Soil Environ. 65 313-319. doi: 10.17221/752/2018-pse
• Arnold M. F. F., Shabab M., Penterman J., Boehme K. L., Griffitts J. S., Walker G. C. (2017). Genome-Wide sensitivity analysis of the microsymbiont Sinorhizobium meliloti to symbiotically important, defensin-like host peptides. mBio 8:e1060-17. doi: 10.1128/mBio.01060-17.
• Backer R., Rokem J. S., Ilangumaran G., Lamont J., Praslickova D., Ricci E., et al (2018). Plant growth-promoting rhizobacteria: context, mechanisms of action, and roadmap to commercialization of biostimulants for sustainable agriculture. Front. Plant Sci. 9:1473. doi: 10.3389/fpls.2018.01473
• Barahona E., Navazo A., Yousef-Coronado F., Aguirre de Cárcer D., Martínez-Granero F., Espinosa-Urgel M., et al (2010). Efficient rhizosphere colonization by Pseudomonas fluorescens f113 mutants unable to form biofilms on abiotic surfaces. Environ. Microbiol. 12 3185-3195. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02291.x

タイトルに関連する用語 (5件)： 農業 ,  科学 ,  トランスポゾン ,  挿入配列 ,  応用