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J-GLOBAL ID：202002267709924084   整理番号：20A1934147

質量分析に基づく水素-重水素交換,架橋及び分子ドッキングによるPD-1/ニボルマブのエピトープ及びパラトープマッピング【JST・京大機械翻訳】

Epitope and Paratope Mapping of PD-1/Nivolumab by Mass Spectrometry-Based Hydrogen-Deuterium Exchange, Cross-linking, and Molecular Docking

著者 (7件)： Zhang Mengru Mira (Department of Chemistry, Washington University, Missouri, United States) ,  Huang Richard Y.-C. (Pharmaceutical Candidate Optimization, Nonclinical Research and Development, Bristol Myers Squibb Company, New Jersey, United States) ,  Beno Brett R. (Molecular Structure & Design, Small Molecule Drug Discovery, Bristol Myers Squibb Company, New Jersey, United States) ,  Deyanova Ekaterina G. (Pharmaceutical Candidate Optimization, Nonclinical Research and Development, Bristol Myers Squibb Company, New Jersey, United States) ,  Li Jing (Pharmaceutical Candidate Optimization, Nonclinical Research and Development, Bristol Myers Squibb Company, New Jersey, United States) ,  Chen Guodong (Pharmaceutical Candidate Optimization, Nonclinical Research and Development, Bristol Myers Squibb Company, New Jersey, United States) ,  Gross Michael L. (Department of Chemistry, Washington University, Missouri, United States)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 92  号： 13  ページ： 9086-9094  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細胞表面の抗原共受容体であるプログラム細胞死-1(PD-1)は,顕著な免疫チェックポイントの一つである。FDAにより承認されたモノクローナル抗体であるニボルマブはPD-1に結合し,その経路を効率的に遮断する。本研究では,PD-1/ニボルマブのエピトープ/パラトープをマッピングするための統合手法を開発した。この手法は水素-重水素交換質量分析(HDX-MS)とそれに続く電子移動解離(ETD),化学的架橋および分子ドッキングを含む。HDX-ETDはアミノ酸分解によるいくつかの結合部位特性化を提供する。化学的架橋は,1つの付加的エピトープ(すなわち,BC-ループ)と重鎖のN末端における潜在的パラトープに関する相補的な情報を提供する。さらに,架橋は,遠隔配座転移を受ける別のループ領域(すなわち,C’Dループ)を同定した。架橋に由来する距離拘束は,分解結晶構造に関して評価したPD-1/ニボルマブの高信頼性モデルの構築を可能にした。この統合戦略は,他の抗原-抗体相互作用を包括的に特性化する機会であり,結合機構の理解を可能にし,将来の抗体治療を設計する。Copyright 2020 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶構造 ,  *質量分析 ,  相互作用 ,  配座転移 ,  アミノ酸 ,  抗原 ,  抗体 ,  受容体 ,  結合部位 ,  重鎖 ,  *エピトープ ,  モノクローナル抗体
準シソーラス用語： 細胞表面 ,  *H/D交換 ,  電子移動解離 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 質量分析  (CC03013N) ,  同位体交換  (CB10020G)

タイトルに関連する用語 (7件)： 質量分析 ,  水素-重水素交換 ,  架橋 ,  分子ドッキング ,  PD-1 ,  ニボルマブ ,  エピトープ