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J-GLOBAL ID：202002267799358661   整理番号：20A1843003

コムギ実生の根系応答重金属Pbストレスのトランスクリプトーム分析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Analysis of Wheat Roots in Response to Heavy Metal Pb Stress

著者 (6件)： Wang Yiren (河南科技学院小麦中心/河南省雑交小麦重点実験室,河南新郷,453003) ,  Nie Mengjie (河南科技学院小麦中心/河南省雑交小麦重点実験室,河南新郷,453003) ,  Wang Yuquan (河南科技学院小麦中心/河南省雑交小麦重点実験室,河南新郷,453003) ,  Hu Xigui (河南科技学院小麦中心/河南省雑交小麦重点実験室,河南新郷,453003) ,  Ding Weihua (河南科技学院小麦中心/河南省雑交小麦重点実験室,河南新郷,453003) ,  Hu Tiezhu (河南科技学院小麦中心/河南省雑交小麦重点実験室,河南新郷,453003)
資料名： Henan Nongye Kexue  (Henan Nongye Kexue)
巻： 49  号： 6  ページ： 8-15  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2918A  ISSN： 1004-3268  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 重金属の鉛(Pb)ストレスに対するコムギのストレス応答の分子機構を調べるために,コムギ品種の矮性58に対する異なる質量濃度[0(対照),40,80,160mg/L]のPbストレスを水耕法により処理し,苗の根をトランスクリプトームした。差次的発現遺伝子をスクリーニングし,GO分類とKEGG濃縮分析を行った。その結果、異なる質量濃度のPb処理下で、小麦幼苗の根長と根数はいずれも抑制され、Pb濃度の上昇に伴い抑制作用が増強されることが分かった。Pbストレス処理とCKの間に38904個の差次的発現遺伝子を得た。そのうち、40、80、160mg/LPbの条件下で、それぞれ6072、16581、16251個の差次的発現遺伝子があった。80mg/LPb処理の差異発現遺伝子を選び、研究重点としてGO分類とKEGG経路濃縮分析を行った。GO分類により、差次的発現遺伝子のアップレギュレーションは、主に免疫系過程、運動過程、代謝過程、リズム性過程及び触媒活性と電子キャリア活性などの方面に集中し、差次的発現遺伝子は主に発育過程、成長過程、定位過程、複製過程、成長過程に蓄積することが明らかになった。生殖過程,輸送活性,酸化防止活性など。KEGGの濃縮分析により、差次的発現遺伝子をアップレギュレーションすることは、主に植物ホルモンシグナル伝達経路、植物-病原相互作用経路、薬物代謝経路、MAPKシグナル経路などに関与し、差次的発現遺伝子を下方制御することは、主に二次代謝物の生合成経路、フェニルプロパノイド生合成経路、及び、フェニルプロパノイド生合成経路に関与することが分かった。抗生物質生合成経路、炭素代謝とショ糖代謝など。Pbストレスに応答した6つの差次的発現遺伝子をRT-PCRによって検証し,その結果,6つの差次的発現遺伝子の発現パターンがRNA-Seq分析結果と一致し,RNA-Seq結果の精度がさらに検証された。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *鉛 ,  *重金属 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *コムギ ,  植物ホルモン ,  品種 ,  成長段階 ,  *実生 ,  アップレギュレーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  生合成経路 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  植物に対する影響  (EE05030G)

タイトルに関連する用語 (9件)： コムギ ,  実生 ,  根系 ,  応答 ,  重金属 ,  Pb ,  ストレス ,  トランスクリプトーム ,  分析