膠芽腫細胞外小胞の短鎖非コードRNA配列決定【JST・京大機械翻訳】

de Mooij Tristan; Peterson Timothy E.; Evans Jared; McCutcheon Brandon; Parney Ian F.; Parney Ian F.

文献

J-GLOBAL ID：202002268449539091 整理番号：20A0327533

膠芽腫細胞外小胞の短鎖非コードRNA配列決定【JST・京大機械翻訳】

Short non-coding RNA sequencing of glioblastoma extracellular vesicles

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資料名：
巻： 146 号： 2 ページ： 253-263 発行年： 2020年
JST資料番号： W4633A ISSN： 1573-7373 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：ドイツ (DEU) 言語：英語 (EN)

全ての核形成細胞のように,グリア芽細胞腫(GBM)細胞は細胞外小胞(EVs)と呼ばれる小さな膜カプセル化粒子を放出する。EVsは発癌性成分を移動させ,短い非コードRNAを移動させることにより腫瘍増殖を促進し,標的細胞遺伝子発現を変化させる。さらに,GBM由来EVsは血液中で検出され,液体生検として役立つ可能性がある。【方法】:EVsをヒトGBM細胞株から培養上清から採取し,逐次遠心分離により精製し,ナノ粒子追跡により定量した。RNAを分離し,短い非コードRNAを配列決定した。データを,HG38を用いてOASIS-2.0プラットフォームを通して分析した。MirTarBaseとMirDBは,それぞれ検証/予測miRNA-遺伝子相互作用を調べた。結果:多くの短い非コードRNAは,GBM EVの中で同定された。GBM EVマイクロRNA(miRNA)アレイを用いた以前の報告により,これらはmiR-21を含む豊富なマイクロRNAを含んでいた。しかしながら,RNA配列決定は,以前にGBM EVと関連していない,全部で712の非コードRNA配列を明らかにした。これらはmiRNAに加えて多くのRNA種(piRNA,snoRNA,snRNA,rRNAおよびyRNA)を含んでいた。miR-21-5p,let-7b-5p,miR-3182,miR-4448,let-7i-5pは最も高い全体的発現を構成した。非コードRNAにより標的化された上部遺伝子は高度に保存され,細胞周期,PI3K/Aktシグナル伝達,p53及びGlioma curated KEGG経路に特異的であった。結論:GBM EVに関する次世代短非コードRNA配列決定は,miRNAアレイを用いた以前の研究からの知見を検証するが,多くの付加的な非コードRNA配列とGBMと以前に関係しないクラスの発現を示す。これは,病態生理学への重要な洞察をもたらし,新しい治療標的を指摘し,疾患負担と治療反応のための新しいバイオマーカーの開発を助ける可能性がある。Copyright Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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細胞生理一般 , 腫ようの化学・生化学・病理学

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