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J-GLOBAL ID：202002268807363011   整理番号：20A1013213

ヒト染色体19の異常な配列特性は11人の非ヒト霊長類を越えて保存される【JST・京大機械翻訳】

Unusual sequence characteristics of human chromosome 19 are conserved across 11 nonhuman primates

著者 (8件)： Harris R. Alan (Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Harris R. Alan (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Raveendran Muthuswamy (Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Raveendran Muthuswamy (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Worley Kim C. (Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Worley Kim C. (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Rogers Jeffrey (Human Genome Sequencing Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Rogers Jeffrey (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, USA)
資料名： BMC Evolutionary Biology (Web)  (BMC Evolutionary Biology (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-12  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7052A  ISSN： 1471-2148  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト染色体19は,遺伝子密度を含む多くのユニークな特徴を有し,ゲノム全体の平均および20の大規模なクラスター化された遺伝子ファミリーを含んでいる。また,それは,あらゆる染色体,特に外側の遺伝子クラスタの最も高いGC含有量を持っている。高GC含有量と高変異性CpG部位の同時高含量は,染色体19が種間及び種間のヌクレオチド多様性のより高いレベルを示し,遺伝子発現を調節するDNAメチル化の大きな変異を有する可能性がある。著者らは,霊長類次数の代表者にわたる染色体19オーソログのGCとCpG含量を調べた。適切なゲノム集合を有するすべての12の霊長類種において,染色体19オーソログは,あらゆる染色体の最も高いGC含有量を有する。CpGジヌクレオチドとCpG島は他の染色体よりも染色体19オーソログにおいてより一般的である。GCとCpG含有量は,一般的に遺伝子クラスタの外側でより高い。ヒトの一般的なdbSNP,アカゲザル,カニ摂食マカク,ヒヒおよびマーモセットのデータセットにおけるSNPに基づく種内変異は,染色体19およびそのオーソログに最も一般的である。系統P保存に基づく種間比較は,染色体19プロモーターフランキングおよびエンハンサー領域に対する加速されたヌクレオチド進化を示す。これらの同じ調節領域は,どの染色体でも最も高いCpG密度を示し,それらがかなりのメチロム調節能を有することを示唆している。染色体19オーソログ,特に外側の遺伝子クラスターにおける高GCとCpG含有量のパターンは,ヒトからマウスのlemurに存在し,74百万年の霊長類進化を表している。多くのCpG変異は,調節領域で起こるこの変異の一部を持つ霊長類種間と間の両方に存在する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  *染色体 ,  ヌクレオチド ,  ヒト ,  *霊長類 ,  クラスタ化 ,  ゲノム ,  アカゲザル ,  ジヌクレオチド ,  エンハンサー領域 ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  オルソログ ,  CpG ,  遺伝子クラスタ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 染色体進化 ,  GC含量 ,  CpGサイト ,  霊長類 ,  変異体 ,  遺伝子調節要素

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (40件)：

• Nat.; The DNA sequence and biology of human chromosome 19; J Grimwood, LA Gordon, A Olsen, A Terry, J Schmutz, J Lamerdin; 428; 2004; 529-535; 10.1038/nature02399; citation_id=CR1
• Mol Biol Evol; TimeTree: a resource for timelines, Timetrees, and divergence times; S Kumar, G Stecher, M Suleski, SB Hedges; 34; 2017; 1812-1819; 10.1093/molbev/msx116; citation_id=CR2
• PLoS Genet; Heterogeneous genomic molecular clocks in Primates; S-H Kim, N Elango, C Warden, E Vigoda, SV Yi; 2; 2006; e163; 10.1371/journal.pgen.0020163; citation_id=CR3
• Sci.; Evolution at two levels in humans and chimpanzees; MC King, AC Wilson; 188; 1975; 107-116; 10.1126/science.1090005; citation_id=CR4
• PLoS Genet; Gene regulation in primates evolves under tissue-specific selection pressures; R Blekhman, A Oshlack, AE Chabot, GK Smyth, Y Gilad; 4; 2008; e1000271; 10.1371/journal.pgen.1000271; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (4件)： ヒト ,  染色体19 ,  霊長類 ,  保存