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J-GLOBAL ID：202002269183741301   整理番号：20A1151612

ブタサークルウイルス3型河北株の全ゲノム配列特徴と遺伝進化分析【JST・京大機械翻訳】

Sequence characterization and genetic evolution analysis of whole genome of porcine circovirus Type 3Hebei strain

著者 (6件)： Wang Chengyu (河北農業大学動物医学院,河北 保定 071001;河北省畜牧獣医研究所,河北 保定 071001) ,  Li Jiefeng (河北省畜牧獣医研究所,河北 保定,071001) ,  Zhao Zhiqiang (河北省畜牧獣医研究所,河北 保定,071001) ,  Duan Baoning (邯鄲市飼料工業弁公室,河北 邯鄲,056002) ,  Yang Wei (河北省畜牧獣医研究所,河北 保定,071001) ,  Ma Yuzhong (河北農業大学動物医学院,河北 保定,071001)
資料名： Gansu Nongye Daxue Xuebao  (Gansu Nongye Daxue Xuebao)
巻： 55  号： 1  ページ： 35-44  発行年： 2020年 
JST資料番号： C2901A  ISSN： 1003-4315  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]ブタサーコウイルス3型(PCV3)の全ゲノム配列を増幅し、その配列特徴及び遺伝進化分析を行う。[方法]PCV3陽性サンプルをテンプレートとして、2対のプライマーを用いて全ゲノム断片を増幅し、シークエンシングし、DNAStarとMEGA-Xソフトウェアで遺伝進化分析を行った。[結果]新しいPCV3株(GenBank登録番号)が発見された。MK105924),PCV3Cap蛋白質は3b亜型であり,河北省9株PCV3Capとの相同性は97.8%99.8%であった。得られたPCV3はPCV1とPCV2の全ゲノム配列との相同性が50%以下であり、遺伝進化ツリー分析の3種類のPCVは異なる分枝にあり、異なる遺伝子型に属することを示した。国内外の他の43株のPCV3全ゲノム配列との相同性は98.7%99.3%であり、そのうちロシアPCV3株(GenBank登録番号)とは一致している。MG679916のホモロジーは99.3%であり、異なるPCV3株間の全ゲノム配列の相同性が高く、明らかな変異が見られなかった。GenBankに発表された全部の国内外の174株のPCV3の全ゲノム配列に遺伝進化系統樹分析を行い、全世界のPCV3及びその亜型の分布に地域差があることを発見した。【結語】PCV1とPCV2は,PCV1とPCV2の異なった遺伝子型に属し,PCV3とPCV3株の間には高い相同性があったが,PCV3とそのサブタイプの分布は,地域とある程度関係していた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  遺伝子型 ,  タンパク質 ,  系統樹 ,  *ゲノム ,  ホモロジー ,  ソフトウェア ,  地域差 ,  相同性 ,  ロシア連邦
準シソーラス用語： 配列解析 ,  GenBank ,  *ゲノム配列 ,  河北省 ,  ブタサーコウイルス2型 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R)

タイトルに関連する用語 (5件)： 株 ,  ゲノム配列 ,  遺伝 ,  進化 ,  分析