文献

J-GLOBAL ID：202002269310811949   整理番号：20A2550408

生物学的関連条件下でのMOF-808触媒による高度に効果的なペプチド結合加水分解の機構【JST・京大機械翻訳】

Mechanism of the highly effective peptide bond hydrolysis by MOF-808 catalyst under biologically relevant conditions

著者 (4件)： Conic Dragan (Division of Quantum Chemistry and Physical Chemistry, Department of Chemistry, KU Leuven, Celestijnenlaan 200F, 3001 Leuven, Belgium. [e-mail]) ,  Pierloot Kristine ,  Parac-Vogt Tatjana N. ,  Harvey Jeremy N.
資料名： Physical Chemistry Chemical Physics  (Physical Chemistry Chemical Physics)
巻： 22  号： 43  ページ： 25136-25145  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0271C  ISSN： 1463-9076  CODEN： PPCPFQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 不活性ペプチド結合の効率的で選択的な加水分解が最も重要である。Zr_6ノードに基づく金属-有機骨格であるMOF-808は,生物学的に適切な条件下でペプチド結合を効率的に加水分解できる。しかし,触媒構造の詳細と根底にある触媒反応機構は,確立するのが困難であった。DFT計算により,まずZr_6ノードのスペシエーションを調べ,水性条件でZr_6O_8H_4-xコアに結合する配位子の性質を同定した。コアは,Zr_6O_8H_4プロトン化状態を強く優先し,ギ酸塩配位子を架橋することによって主に修飾され,Zr_6(μ_3-O)_4(μ_3-OH)_4(BTC)_2(HCOO)_6およびZr_6(μ_3-O)_4(μ_3-OH)_4(BTC)_2(HCOO)_5(OH)(H_2O)を,生理学的pHで最も好ましい構造として与えると予測した。GlyGlyペプチドは,ギ酸配位子の結合モードに類似して末端カルボン酸エステルを通して配位を含む好ましい構造で,いくつかの異なる方法でMOFを結合できる。アミドカルボニル酸素が金属コアを配位する前反応性結合モードは自由エネルギーにおいて7kcal高い。好ましい反応経路は,2つの近接する遷移状態を持つと予測され,そのどれかは,それぞれ,アミド炭素原子とC-N結合開裂への求核攻撃であり,計算した相対自由エネルギーは,それぞれ31と32kcal mol-1であった。Zr_6ノードでの水および水酸化物によるギ酸の置換は可能であると予測されるが,加水分解機構には役割を果たさないようである。Copyright 2020 Royal Society of Chemistry All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 自由エネルギー ,  *加水分解 ,  プロトン化 ,  エステル ,  *ペプチド ,  水酸化物 ,  遷移状態 ,  開裂反応 ,  *ペプチド結合 ,  密度汎関数法 ,  反応経路 ,  スペシエーション ,  脂肪族カルボン酸
準シソーラス用語： 結合モード ,  MOF【配位高分子】 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 分子間相互作用  (BH07020P) ,  配位化合物一般  (CE01010G) ,  第4族,第5族元素の錯体  (CE01070U) ,  無機化合物一般及び元素  (CD01010D)

物質索引 (1件)： ギ酸

タイトルに関連する用語 (5件)： 生物学 ,  MOF ,  触媒 ,  ペプチド結合 ,  加水分解