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J-GLOBAL ID：202002269914298282   整理番号：20A0024339

高スループット配列決定は,健康なおよび病気のcaulerpa lentillifera間の微生物群集構造と多様性の差異を明らかにした【JST・京大機械翻訳】

High-throughput sequencing revealed differences of microbial community structure and diversity between healthy and diseased Caulerpa lentillifera

著者 (13件)： Liang Zhourui (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Liang Zhourui (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Liu Fuli (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Liu Fuli (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Wang Wenjun (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Wang Wenjun (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Zhang Pengyan (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Zhang Pengyan (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Sun Xiutao (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Sun Xiutao (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Wang Feijiu (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao, China) ,  Wang Feijiu (Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao, China) ,  Kell Heather (College of Science and Engineering, Flinders University, Adelaide, Australia)
資料名： BMC Microbiology (Web)  (BMC Microbiology (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7367A  ISSN： 1471-2180  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Caulerpa lentliferaは世界で最も重要な経済的緑藻の1つである。消費に対する需要の増加により,日本およびベトナムにおける最近の数十年におけるC.lentliferaの商業的栽培が行われている。C.lentlifera栽培の増加に伴い,病害が増加する。C.lentlifera農場における着生植物または他の微生物の発生は,C.lentliferaにおける病気に寄与する重要な因子である可能性があると仮定した。主な目的は,本研究における高スループット配列決定と生物情報学分析の結果を通して,健康と病気のC.lentliferaと重要な着生植物と他の微生物との間の微生物群集構造と多様性における差異を得ることである。16S rDNA,18S rDNAおよび内部転写スペーサー(ITS)ハイスループット配列決定を用いて,全部で14,050,2479および941の操作分類単位(OTUs)を得た。16S rDNA塩基配列決定と18S rDNA配列決定は,微生物群集多様性が,健全なC.lentliferaにおけるよりも病気のC.lentliferaにおいて高いことを示した。PCoAの結果とUPGMAの結果は,健康なおよび病的な藻類試料が特徴的に異なる微生物群集を持つことを示した。主要な原核生物門は,すべての配列においてProteobacteria,プランクトミケス門,Bacteroidetes,藍藻類,Acidobacteria,AcidobacteriaおよびParcubacteriumであった。Chlorophytaは最も豊富な真核生物門であり,18S rDNA配列決定に基づいてBacillariophytaが続いた。AscomycotaはITS配列決定に基づく健康なC.lentliferaで検出された優勢な真菌門であったが,真菌類は病害C.lentliferaでは珍しく,Ascomycotaはおそらく健康なC.lentliferaの真菌内共生生物であることを示唆した。健康なC.lentliferaにおけるよりも,病気のC.lentliferaにおいて,Bacteroidetes,藍藻類,Bacillariophyta,UlvalesおよびTetaselmisの有意に高い豊度があった。病害発生は,Tax4Funツールを用いた予測機能分析により,C.lentliferaにおける原核生物群集の炭水化物代謝,環境情報処理および遺伝的情報処理を有意に変化させた。C.lentlifera農場サイトにおけるBacteroidetes,藍藻類,Bacillariophyta,UlvalesおよびTetaselmisの発生は,C.lentliferaにおける病気に寄与する重要な因子であった。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 機能分析 ,  原核生物 ,  ベトナム社会主義共和国 ,  真菌類 ,  真核生物 ,  情報処理 ,  スペーサ ,  *微生物 ,  農場 ,  藍藻類 ,  栽培 ,  緑藻類 ,  遺伝 ,  糖質代謝 ,  子嚢菌類

分類 (3件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  下水,廃水の生物学的処理  (SC03060H)

引用文献 (79件)：

• FEMS Microbiol Ecol; Hologenome theory supported by cooccurrence networks of species-specific bacterial communities in siphonous algae (Caulerpa); T Aires, Y Moalic, EA Serrao, S Arnaud-Haond; 91; 7; 2015; 409-417; 10.1093/femsec/fiv067; citation_id=CR1
• PLoS One; Invasion is a community affair: clandestine followers in the bacterial community associated to green algae, Caulerpa racemosa, track the invasion source; T Aires, EA Serrão, G Kendrick, CM Duarte, S Arnaud-Haond; 8; 2013; e68429; 10.1371/journal.pone.0068429; citation_id=CR2
• Hydrobiologia.; The symbiotic role of marine microbes on living surfaces; E Armstrong, L Yan, KG Boyd, PC Wright, JG Burgess; 461; 2001; 37-40; 10.1023/A:1012756913566; citation_id=CR3
• Proc Natl Acad Sci U S A; Fungal endophytes limit pathogen damage in a tropical tree; AE Arnold, LC Mejia, D Kyllo, EI Rojas, Z Maynard, N Robbins, EA Herre; 100; 26; 2003; 15649-15654; 10.1073/pnas.2533483100; citation_id=CR4
• Bioinformatics.; Tax4Fun: predicting functional profiles from metagenomic 16S rRNA data; KP Aßhauer, B Wemheuer, R Daniel, P Meinicke; 31; 17; 2015; 2882-2884; 10.1093/bioinformatics/btv287; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： 高スループット ,  病気 ,  Caulerpa ,  微生物群集構造 ,  多様性 ,  差異