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J-GLOBAL ID：202002270129867776   整理番号：20A2645344

熱,寒冷,および乾燥ストレス下での倍数体Brassica napusにおける重複遺伝子発現および選択的スプライシングへの全体的洞察【JST・京大機械翻訳】

Global insights into duplicated gene expression and alternative splicing in polyploid Brassica napus under heat, cold, and drought stress

著者 (2件)： Lee Joon Seon (Department of Botany, University of British Columbia, 6270 University Blvd, Vancouver, BC, V6T 1Z4, Canada) ,  Adams Keith L. (Department of Botany, University of British Columbia, 6270 University Blvd, Vancouver, BC, V6T 1Z4, Canada)
資料名： Plant Genome  (Plant Genome)
巻： 13  号： 3  ページ： e20057  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5739A  ISSN： 1940-3372  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 倍数性は植物進化中の一般的な過程であり,植物ゲノムの構造と進化に大きな影響を及ぼした。多くの重要な作物植物は倍数体である。倍数体における重複遺伝子の発現パターンには大きな関心が寄せられている。選択的スプライシング(AS)は,単一型のmRNAから複数の最終転写物型を産生する遺伝子発現の基本的側面である。倍数体におけるASに及ぼす非生物的ストレス条件の影響は,ほとんど注目されていない。著者らは,B.rapa(A_T)およびB.oleracea(C_T)由来の同種四倍体であるBrassica napusの地球規模トランスクリプトーム解析を,寒冷,熱および干ばつストレス処理を受けた植物のRNA-Seqにより行った。重複遺伝子の27,360対の解析は,遺伝子発現における全体的なA_Tサブゲノムバイアスと,全ての3つのストレス処理下の選択的スプライシングの程度におけるC_Tサブゲノムバイアスを明らかにした。より多くの遺伝子は,ストレスに応答して減少した発現で増加した。各タイプのASについて,発現レベルとAS頻度の間に負の相関が見られた。寒冷ストレスは遺伝子発現とASの最大変化を生じた。寒冷誘導AS変化は,暑熱ストレスによるよりも乾燥によって発生するそれらと共有されるようであった。倍数体における複製がどのように寒冷ストレスに応答するかの動力学を示す事例研究として,FLCとCCA1のホメオログを使用した。著者らの結果は,重複遺伝子間の遺伝子発現とASパターンの発散が,非生物ストレス因子に応答するとき倍数体の柔軟性を増加させるかもしれないことを示唆する。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農作物 ,  mRNA ,  *遺伝子 ,  干ばつ ,  寒冷ストレス ,  四倍体 ,  *倍数体 ,  事例研究 ,  *遺伝子発現 ,  暑熱ストレス ,  *選択的スプライシング
準シソーラス用語： *Brassica napus ,  トランスクリプトーム解析 ,  *乾燥ストレス ,  非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 乾燥ストレス ,  倍数体 ,  Brassica ,  遺伝子発現 ,  選択的スプライシング ,  洞察