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J-GLOBAL ID：202002270533886427   整理番号：20A2529901

DNAと相互作用する能力を有する最良のエンジェンダードCamelラクトフェリン-Deriveペプチドを選択するための計算ペプチド工学的アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Computational Peptide Engineering Approach for Selection the Best Engendered Camel Lactoferrin-Derive Peptide with Potency to Interact with DNA

著者 (4件)： Pirkhezranian Zana (Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran) ,  Tahmoorespur Mojtaba (Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran) ,  Monhemi Hassan (Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Neyshabur, Neyshabur, Iran) ,  Sekhavati Mohammad Hadi (Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran)
資料名： International Journal of Peptide Research and Therapeutics  (International Journal of Peptide Research and Therapeutics)
巻： 26  号： 4  ページ： 2203-2212  発行年： 2020年 
JST資料番号： W4483A  ISSN： 1573-3904  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 抗菌ペプチド(AMPs)は,貴重な生物学的効果を有する天然で安全な短いペプチドである。今日,これらの構成要素とそれらの重要性は,それらの作用機序を決定するために多くの研究者の注意を引き付けている。コンピュータペプチド工学はAMPの安定性と効力を研究するための有用な洞察を供与できる。本研究では,CLF36,キメラペプチド由来ラクダラクトフェリンの効果を改善するために,ペプチド-DNA相互作用への原子洞察をMDシミュレーションを用いて解析した。標的変異体を野生型アミノ酸配列で実施し,得られたペプチドをペプチド-DNA相互作用解析に対して相同性モデル化した。SASA,水素結合および遊離結合エネルギー分析は,この研究における野生型ペプチドの全ての変化がペプチド-DNA相互作用を改善することを明らかにした。in silico結果は,GLU12とALAの同時置換および野生型におけるSER36の除去も,DNAとの複合体形成に対しより実質的な効果を有することを示した。この研究の得られた結果は,実験研究に使用するための工学ペプチドの安定性と効力を改善するのに有用である。Copyright Springer Nature B.V. 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水素結合 ,  *相互作用 ,  計算機シミュレーション ,  *ペプチド ,  *DNA【核酸】 ,  アミノ酸配列 ,  複合体 ,  *ラクトフェリン ,  相同性 ,  野生型 ,  コンピュータ
準シソーラス用語： in silico ,  エネルギー解析 ,  分子動力学シミュレーション ,  抗菌ペプチド ,  *ペプチド工学 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 抗菌ペプチド ,  Camelラクトフェリン ,  DNA ,  MDシミュレーション

分類 (2件)： 生理活性ペプチド  (EB08100U) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (7件)： DNA ,  相互作用 ,  能力 ,  ラクトフェリン ,  ペプチド ,  計算 ,  ペプチド工学