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J-GLOBAL ID：202002270557770168   整理番号：20A0194011

マルチスケールシミュレーションはインフラマソーム集合の動力学機構を解明する【JST・京大機械翻訳】

Multiscale simulation unravel the kinetic mechanisms of inflammasome assembly

著者 (2件)： Su Zhaoqian (Department of Systems and Computational Biology, Albert Einstein College of Medicine, 1300 Morris Park Avenue, Bronx, NY 10461, United States of America) ,  Wu Yinghao (Department of Systems and Computational Biology, Albert Einstein College of Medicine, 1300 Morris Park Avenue, Bronx, NY 10461, United States of America)
資料名： Biochimica et Biophysica Acta  (Biochimica et Biophysica Acta)
巻： 1867  号： 2  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0207A  ISSN： 0005-2728  CODEN： BBBMBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 先天性免疫系において,外部病原体の侵入からの宿主防御は炎症反応を誘発する。炎症経路に関与する蛋白質は,多くの場合,死ドメインスーパーファミリーに属するドメイン間のホモタイプ相互作用を介して,「inflamマソーム」と呼ばれる超分子オリゴマーに凝集することがしばしば見出された。これらの螺旋状分子機構の形成について多くのことが知られているが,それらの集合の動力学と各ドメインの構造の間の詳細な相関はまだ十分に理解されていない。試験システムとしてアダプタ分子ASCのPYDドメインにより形成されたフィラメントを用いて,inflamマソーム集合の動力学を研究するための新しいマルチスケールシミュレーションフレームワークを構築した。フィラメント集合は多段階であるが,高度に協調的な過程であることを見出した。さらに,ASC~PYDフィラメントのドメインサブユニット間に3種類の結合界面が存在した。マルチスケールシミュレーション結果は,ドメイン集合の動力学が,3つの結合界面を通して分子認識のエネルギー論を定義する一次蛋白質配列において根づいていることを示唆する。界面Iは,集合の速度論と熱力学の両方を媒介する他の2つよりも,より調節的な役割を果たしている。最終的に,著者らの計算フレームワークの効率は,系統的規模で突然変異体を設計することを可能にし,フィラメント集合に及ぼすそれらの影響を予測することを可能にした。要約すると,これは著者らの知る限りでは,inflamマソーム組立の空間時間過程をモデル化するための最初のシミュレーション法である。本研究は,先天性免疫系におけるinflamマソームの機能を研究するための一連の既存の実験技術に対する有用な追加である。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *界面 ,  熱力学 ,  自然免疫 ,  死 ,  モデリング ,  相互作用 ,  超分子 ,  アミノ酸配列 ,  計算機シミュレーション ,  病原体 ,  シミュレーション ,  分子認識 ,  オリゴマ ,  タンパク質 ,  炎症

著者キーワード (5件)： インフラマソーム ,  マルチスケールモデリング ,  複雑な組立 ,  自然免疫系 ,  計算機シミュレーション

分類 (2件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： マルチスケールシミュレーション ,  インフラマソーム ,  集合 ,  動力学機構