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J-GLOBAL ID：202002270834529109   整理番号：20A1537814

Cronobacter sakazakii SP291におけるXero耐性のRNA配列決定に基づく転写概要【JST・京大機械翻訳】

RNA Sequencing-Based Transcriptional Overview of Xerotolerance in Cronobacter sakazakii SP291

著者 (12件)： Srikumar Shabarinath ,  Cao Yu ,  Yan Qiongqiong ,  Van Hoorde Koenraad ,  Nguyen Scott ,  Cooney Shane ,  Gopinath Gopal R. ,  Tall Ben D. ,  Sivasankaran Sathesh K. ,  Lehner Angelika ,  Stephan Roger ,  Fanning Seamus
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 85  号： 3  ページ： Null  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ABSTRACT Cronobacter sakazakiiは,粉末乳児食品処方に疫学的にリンクした耐食性新生児病原体であり,しばしば高い死亡率をもたらす。ここでは,トランスクリプトーム配列決定(RNA-seq)を用いて,乾燥条件におけるC.sakazakiiの生存への転写洞察を与えた。RNA-seqデータは,全C.sakazakii遺伝子の約22%が,有意にアップレギュレートされ,9%が乾燥生存中にダウンレギュレートされることを示した。逆転写-定量的PCR(qRT-PCR)を用いてRNA-seqデータを検証したところ,一次乾燥応答は乾燥の4時間試験中に徐々にダウンレギュレートされ,一方二次応答は構成的にアップレギュレートされた。C.sakazakiiの4時間乾燥耐性は細菌細胞周囲の即時微小環境に依存した。トリプティカーゼ大豆ブロス(TSB)塩の除去と微小環境における無菌乳児用調製物の導入は,C.sakazakii SP291の乾燥生存を強化した。顕著な二次細菌乾燥応答であるotsA及びotsBによりコードされたトレハロース生合成経路は,乾燥C.sakazakiiにおいて高度にアップレギュレートされた。C.sakazakii SP291ΔotsABは8時間乾燥生存アッセイにおいて同質遺伝子野生型と比較して有意に阻害され,乾燥生存におけるトレハロースの生理学的重要性を確認した。全体として,乾燥時のCronobacter sakazakiiにおけるトレハロース代謝の表現型重要性の確認とともに,包括的RNA-seqに基づく転写概要を提供した。IMPORTANCE Cronobacter sakazakiiは新生児健康に重要な病原体であり,粉末乳児用調製粉乳(PIF)とその関連生産環境のような乾燥食品マトリックスに持続することが知られている。感染が新生児で報告されている場合,死亡率は高い。これらの低水分環境の生存におけるこの細菌の成功は,Cronobacter種が様々な環境シグナルに応答することを示唆する。したがって,これらの生態学的ニッチにおけるこの病原体の持続性を助けるこれらのシグナルを理解することは,PIFの汚染リスクを低減するための戦略の開発に向けた重要なステップである。本研究は,乾燥条件におけるこの病原体の持続性において役割を果たす候補遺伝子の同定をもたらし,それによって,C.sakazakiiのPIF関連生存を緩和するための将来の戦略を設計するためのモデル標的として役立つ。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  新生児 ,  ダイズ ,  表現型 ,  水分 ,  病原体 ,  乳児 ,  疫学 ,  野生型 ,  トランスクリプトーム ,  定量的PCR法 ,  二糖類 ,  ピラノシド ,  グルコシド
準シソーラス用語： *Cronobacter sakazakii , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

物質索引 (1件)： トレハロース

タイトルに関連する用語 (5件)： Cronobacter ,  耐性 ,  RNA ,  転写 ,  概要