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J-GLOBAL ID：202002270985799702   整理番号：20A0012021

フラグメント分子軌道計算を用いたヒト免疫グロブリンGのRNAアプタマー-Fc領域の結合相互作用解析【JST・京大機械翻訳】

Binding interaction analysis of RNA aptamer-Fc region of human immunoglobulin G using fragment molecular orbital calculation

著者 (5件)： Yoshida Hisae (Department of Chemical Biology and Applied Chemistry, College of Engineering, Nihon University, 1 Nakagawara, Tokusada, Tamura-machi, Koriyama, Fukushima 963-8642, Japan) ,  Sato Koki (Department of Chemical Biology and Applied Chemistry, College of Engineering, Nihon University, 1 Nakagawara, Tokusada, Tamura-machi, Koriyama, Fukushima 963-8642, Japan) ,  Ishikawa Takeshi (Department of Chemistry and Biotechnology, Faculty of Engineering, Kagoshima University, 1-21-40 Korimoto, Kagoshima, Kagoshima 890-0065, Japan) ,  Sakamoto Taiichi (Department of Life Science, Faculty of Advanced Engineering, Chiba Institute of Technology, 2-17-1 Tsudanuma, Narashino, Chiba 275-0016, Japan) ,  Yamagishi Kenji (Department of Chemical Biology and Applied Chemistry, College of Engineering, Nihon University, 1 Nakagawara, Tokusada, Tamura-machi, Koriyama, Fukushima 963-8642, Japan)
資料名： Chemical Physics Letters  (Chemical Physics Letters)
巻： 738  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0824A  ISSN： 0009-2614  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト免疫グロブリンG1(hFc1)のFc領域に対するRNAアプタマーの高親和性と特異性を理解するために,RNAアプタマー-hFc1複合体の結合プロファイルを,ab initioフラグメント分子軌道計算を用いて研究することにより解析した。著者らの計算により,塩基フリップG7ヌクレオチドはリン酸及び塩基グループにおけるhFc1とのロバストな相互作用エネルギーによりhFc1結合に重要であることを明らかにした。G7ヌクレオチドはhFc1分子表面と高度の形状相補性を示すことが示唆された。本研究は,hFc1へのRNAアプタマーの結合への物理化学的洞察を提供する。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *相互作用 ,  分子表面 ,  ヌクレオチド ,  相補性 ,  複合体 ,  ロバスト性 ,  *分子軌道計算 ,  物理化学 ,  リン酸 ,  親和性
準シソーラス用語： 相互作用エネルギー ,  特異性 ,  *RNAアプタマー ,  *ヒト免疫グロブリンG , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNAアプタマー ,  ヒト免疫グロブリンG ,  フラグメント分子軌道計算 ,  相互作用解析 ,  結合プロファイル

分類 (3件)： 分子の電子構造  (BH05010Q) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： フラグメント ,  分子軌道計算 ,  ヒト免疫グロブリンG ,  RNAアプタマー ,  相互作用 ,  解析