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J-GLOBAL ID：202002271406651008   整理番号：20A2755498

Arabidopsis近縁Pachycladonチーズmaniiのゲノムドラフトはニュージーランドの高紫外線B放射線環境を許容する新規戦略を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome draft of the Arabidopsis relative Pachycladon cheesemanii reveals novel strategies to tolerate New Zealand’s high ultraviolet B radiation environment

著者 (13件)： Dong Yanni (School of Fundamental Sciences, Massey University, Palmerston North, New Zealand) ,  Gupta Saurabh (Department Molecular Biology, Institute of Biochemistry and Biology, University of Potsdam, Potsdam, Germany) ,  Sievers Rixta (School of Agriculture & Environment, Massey University, Palmerston North, New Zealand) ,  Wargent Jason J. (School of Agriculture & Environment, Massey University, Palmerston North, New Zealand) ,  Wheeler David (School of Fundamental Sciences, Massey University, Palmerston North, New Zealand) ,  Putterill Joanna (School of Biological Sciences, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  Macknight Richard (Biochemistry Department, School of Biomedical Sciences, University of Otago, Dunedin, New Zealand) ,  Gechev Tsanko (Department of Plant Physiology and Molecular Biology, University of Plovdiv, Plovdiv, Bulgaria) ,  Gechev Tsanko (Center of Plant Systems Biology and Biotechnology (CPSBB), Plovdiv, Bulgaria) ,  Mueller-Roeber Bernd (Department Molecular Biology, Institute of Biochemistry and Biology, University of Potsdam, Potsdam, Germany) ,  Mueller-Roeber Bernd (Center of Plant Systems Biology and Biotechnology (CPSBB), Plovdiv, Bulgaria) ,  Mueller-Roeber Bernd (Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Potsdam, Germany) ,  Dijkwel Paul P. (School of Fundamental Sciences, Massey University, Palmerston North, New Zealand)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： PachycladonチーズマンニはArabidopsis thalianaの近縁であり,ニュージーランドの南島に広く分布する異質四倍体多年生草本である。それは1000mまでの高度で成長し,そこでは比較的高いレベルの紫外線(UV)-B放射を受ける。PachycladonがUV-Bストレスに対処する方法に関する最初の洞察を得るために,著者らはそのゲノムを配列決定し,2つのPachycladon系統のUV-B耐性を,異なる高度からの2つのA.thalianaの系統と比較した。P.チーズmaniiの高品質ドラフトゲノムを,保存単一コピー植物オーソログの高い割合で組み立てた。アブラナ科の他の種からのゲノムとのシンテニー分析は,アブラナ科系統IからのBoechera厳格とP.チーズmaniiの密接な系統発生関係を見出した。UV-B照射は,P.チーズmanii系統よりもA.thaliana系統においてより大きな成長減少を引き起こしたが,1つのP.チーズmanii系統では成長は減少しなかった。A.thaliana UV-B放射線応答遺伝子の同族体はP.チーズmaniiで重複し,それらの遺伝子の発現分析はP.チーズmaniiの耐性機構がA.thalianaと異なることを示した。P.チーズmaniiゲノムはA.thalianaとの密接な類似性を示すが,植物が比較的高いUV-B照射を許容する新しい戦略を進化させるようである。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *紫外線 ,  放射線 ,  遺伝子 ,  ニュージーランド ,  系統発生 ,  *ゲノム ,  アブラナ科 ,  多年生草 ,  四倍体 ,  *Arabidopsis ,  Arabidopsis thaliana
準シソーラス用語： Boechera ,  シンテニー ,  UV-B ,  オルソログ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 非生物的ストレス ,  Arabidopsis ,  ゲノムアセンブリ ,  Pachycladon ,  UV-B耐性

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (73件)：

• J Biogeogr; Phylogeny, biogeography and adaptive radiation of Pachycladon (Brassicaceae) in the mountains of South Island, New Zealand; P Heenan, A Mitchell; 30; 2003; 1737-1749; 10.1046/j.1365-2699.2003.00941.x; citation_id=CR1
• Pachycladon; Wild crop relatives: genomic and breeding resources wild relatives of oilseeds; 2011; 227-249; CR2; K Yogeeswaran, C Voelckel, S Joly, P Heenan; citation_publisher=Springer
• Curr Opin Plant Biol; Epigenetic and developmental regulation in plant polyploids; Q Song, ZJ Chen; 24; 2015; 101-109; 10.1016/j.pbi.2015.02.007; citation_id=CR3
• BMC Evol Biol; Island species radiation and karyotypic stasis in Pachycladon allopolyploids; T Mandakova, PB Heenan, MA Lysak; 10; 2010; 367; 10.1186/1471-2148-10-367; citation_id=CR4
• Mol Phylogenet Evol; A Pleistocene inter-tribal allopolyploidization event precedes the species radiation of Pachycladon (Brassicaceae) in New Zealand; S Joly, PB Heenan, PJ Lockhart; 51; 2009; 365-372; 10.1016/j.ympev.2009.02.015; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (10件)： Arabidopsis ,  縁 ,  チーズ ,  ゲノム ,  ドラフト ,  ニュージーランド ,  紫外線B放射 ,  環境 ,  許容 ,  戦略