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J-GLOBAL ID：202002271417410855   整理番号：20A1658610

GEOデータベースに基づく下垂体プロラクチノーマ発生の鍵となる差異遺伝子をスクリーニングした。【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis of key differential genes involved in the progression of prolactinoma based on GEO data-base

著者 (6件)： Zheng Shihao (福建省立医院,福建 福州,350001) ,  Zhang Yang (福建省立医院,福建 福州,350001) ,  Yang Bo (福建省立医院,福建 福州,350001) ,  Chen Zhongyi (福建省立医院,福建 福州,350001) ,  Huang Shaosong (福建省立医院,福建 福州,350001) ,  Huang Shengyue (福建省立医院,福建 福州,350001)
資料名： Zhongguo Shiyong Shenjing Jibing Zazhi  (Zhongguo Shiyong Shenjing Jibing Zazhi)
巻： 23  号： 7  ページ： 570-575  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3947A  ISSN： 1673-5110  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:GEOデータベースを用い、プロラクチン腫の発生発展過程における差異遺伝子及び潜在的相互作用機序を検討し、プロラクチン腫の研究及び治療に新たな標的を提供する。方法:GEOデータベースGSE119063を研究対象とし、R言語を用いてチップ中の差異遺伝子を選別し、選別した遺伝子を用いて機能濃縮分析を行い、タンパク質相互作用ネットワーク図を構築し、プロラクチン腫瘍の発生発展の関連メカニズムを検討する。結果:プロラクチン腫と正常下垂体組織の間の差異遺伝子279個を選別し、そのうち23個を上方制御し、256個を発現ダウンレギュレーションした。遺伝子オントロジー(geneontology、GO)の濃縮分析は、差異遺伝子が主に細胞外マトリックス、小胞体の内腔などの細胞構造に分布し、主に生殖、感覚及び視覚系の発育、受容体リガンドの活動、成長因子の活性、及び成長に関与することを示した。膜貫通受容体タンパク質チロシンキナーゼ活性などの分子機能。京都遺伝子と遺伝子百科全書(kyotoencyclopediaofgenesandgenonmes,KEGG)の経路濃縮分析を通じて、差異遺伝子は主にTGF-βシグナル経路、幹細胞多能性制御シグナル経路、および遺伝子伝達経路などであることが明らかになった。レチノールの新陳代謝経路などの通路に濃縮する。タンパク質相互作用ネットワークを通じて、さらに、下垂体腫瘍の発生発展に関与する可能性のある20個の重要な遺伝子を発見し、SOX2、PAX6、SOX9、POMCなどを含む。結論:本研究は,SOX2,PAX6,SOX9,POMCなどの下垂体プロラクチン腫の鍵となる差次的遺伝子を選別し,TGF-βシグナル伝達経路に影響を及ぼすことにより,プロラクチン腫の発生と進行に影響する。その後のプロラクチン腫の基礎研究と治療に新しい標的を提供できる。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *データベース ,  ネットワーク ,  *遺伝子 ,  *脳下垂体 ,  腫瘍 ,  小胞体 ,  LTH【ホルモン】 ,  幹細胞 ,  *プロラクチノーマ ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  TGFβ ,  細胞外マトリックス
準シソーラス用語： 蛋白質間相互作用 ,  遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  内分泌系の腫よう  (GL04000P) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： データベース ,  下垂体 ,  プロラクチノーマ ,  鍵 ,  差異 ,  遺伝子 ,  スクリーニング