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J-GLOBAL ID：202002272085103940   整理番号：20A2520441

モンゴル,韓国,およびウズベキスタン古代ヒトDNAサンプル間の皮膚色素沈着の違い【JST・京大機械翻訳】

Skin Pigmentation Differences between Mongolian, Korean, and Uzbekistan Ancient Human DNA Samples

著者 (5件)： Bazarragchaa Munkhtsetseg (Department of Molecular Biology and Genetics, School of Biomedicine, Mongolian National University of Medical Sciences, Ulaanbaatar, Mongolia) ,  Uuganbayar Udval (Department of Molecular Biology and Genetics, School of Biomedicine, Mongolian National University of Medical Sciences, Ulaanbaatar, Mongolia) ,  Lee Kwang-Ho (Department of Life Science, College of Natural Sciences, Chung-Ang University, Seoul, Republic of Korea) ,  Kim Kyung-Yong (Institute of Gene and Genome Research, College of Medicine, Chung-Ang University, Seoul 06974, Republic of Korea) ,  Kim Kijeong (Institute of Gene and Genome Research, College of Medicine, Chung-Ang University, Seoul 06974, Republic of Korea)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.本研究は,モンゴル,韓国,およびウズベキスタンから古代のヒト骨から分離した古代および分解DNAからのOCA2遺伝子のイントロン領域におけるSNP rs1545397を同定するためのリアルタイムPCRの使用を報告する。このSNPは皮膚色素沈着のマーカーである。LightCyclerベースのプローブ(HybProbes)を設計した。LightCycler(バージョン2.0)システムをリアルタイムPCRのために使用した。結果.SNP rs1545397の3つの異なる遺伝子型のリアルタイムPCRの結果を,直接配列決定のそれらと比較した。遺伝子型決定には融解曲線分析を用いた。3つの遺伝子型が区別された:ホモ接合T(T/T)SNP型は[数式:原文を参照]で明確な融解ピークを形成し,ホモ接合A(A/A)SNP型は[数式:原文を参照]で明確な融解ピークを形成し,ヘテロ接合A/T SNP型は[数式:原文を参照]と[数式:原文を参照]で2つの異なる融解ピークを形成した。本研究で試験したモンゴルのaDNA試料は,3種類のSNP(A/T,A/A,およびT/T)を,明確に優勢なタイプは観察されなかった。対照的に,韓国のaDNA試料はアジアの遺伝子型(T/T)を持っていたが,Uzbekistan aDNA試料はアジアの遺伝子型(T/T)よりもヨーロッパの遺伝子型(A/A)が多かった。【結論】ヒトモンゴルaDNA試料は,A/T,A/A,およびT/T SNP rs1545397で,明確な優性遺伝子型はなかった。aDNAとの他のカップリング形態の考古学的およびaDNA研究と組み合わせたとき,我々の結果は,モンゴルの先史個体群が皮膚色および形態学的形質のかなりの不均一性を有し,新石器時代において,ユーラシアまたは混合個体群がモンゴルの西部に生息していると推論する。Copyright 2020 Munkhtsetseg Bazarragchaa et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヘテロ接合 ,  *DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  ヒト ,  大韓民国 ,  モンゴル国 ,  ヨーロッパ ,  個体群 ,  イントロン ,  ウズベキスタン共和国 ,  リアルタイムPCR法
準シソーラス用語： ダイレクトシークエンス法 ,  古代 ,  遺伝子タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (21件)：

• K. Prüfer, F. Racimo, N. Patterson, F. Jay, S. Sankararaman, S. Sawyer, A. Heinze, G. Renaud, P. H. Sudmant, C. de Filippo, H. Li, S. Mallick, M. Dannemann, Q. Fu, M. Kircher, M. Kuhlwilm, M. Lachmann, M. Meyer, M. Ongyerth, M. Siebauer, C. Theunert, A. Tandon, P. Moorjani, J. Pickrell, J. C. Mullikin, S. H. Vohr, R. E. Green, I. Hellmann, P. L. F. Johnson, H. Blanche, H. Cann, J. O. Kitzman, J. Shendure, E. E. Eichler, E. S. Lein, T. E. Bakken, L. V. Golovanova, V. B. Doronichev, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, B. Viola, M. Slatkin, D. Reich, J. Kelso, S. Pääbo, "The complete genome sequence of a Neanderthal from the Altai Mountains," Nature, vol. 505, no. 7481, pp. 43-49, 2014.
• M. Meyer, M. Kircher, M. T. Gansauge, H. Li, F. Racimo, S. Mallick, J. G. Schraiber, F. Jay, K. Prufer, C. de Filippo, P. H. Sudmant, C. Alkan, Q. Fu, R. Do, N. Rohland, A. Tandon, M. Siebauer, R. E. Green, K. Bryc, A. W. Briggs, U. Stenzel, J. Dabney, J. Shendure, J. Kitzman, M. F. Hammer, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, N. Patterson, A. M. Andres, E. E. Eichler, M. Slatkin, D. Reich, J. Kelso, S. Paabo, "A high-coverage genome sequence from an archaic Denisovan individual," Science, vol. 338, no. 6104, pp. 222-226, 2012.
• D. Tumen, "Paleoanthropology of the ancient population of Mongolia," Mongolian Journal of Anthropology, Archaeology and Ethnology, vol. 2, no. 254, pp. 90-108, 2006.
• D. Tumen, D. Khatanbaatar, M. Erdene, G. Ankhsanaa, C. Vanchigdash, Ancient Bronze Age and Xiongnu cultures in Mongolia, Ulaanbaatar University and Institute of Northern Cultures, 2011.
• V. V. Volkov, Olennie Kamni Mongolii [Deer Stones of Mongolia], Ulan-Bator, 1981.

タイトルに関連する用語 (8件)： モンゴル ,  韓国 ,  ウズベキスタン ,  古代 ,  ヒト ,  DNA ,  サンプル ,  皮膚色素沈着