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J-GLOBAL ID：202002272565192098   整理番号：20A2796647

iODA:異種マルチオミクスデータからの癌経路一貫性解析のための統合ツール【JST・京大機械翻訳】

iODA: An integrated tool for analysis of cancer pathway consistency from heterogeneous multi-omics data

著者 (7件)： Yu Chunjiang (School of Biotechnology, Suzhou Industrial Park Institute of Service Outsourcing, Suzhou, China) ,  Yu Chunjiang (Center for Systems Biology, Soochow University, Suzhou, China) ,  Qi Xin (School of Chemistry, Biology and Material Engineering, Suzhou University of Science and Technology, Suzhou, China) ,  Qi Xin (Center for Systems Biology, Soochow University, Suzhou, China) ,  Lin Yuxin (Center for Systems Biology, Soochow University, Suzhou, China) ,  Li Yin (Center for Systems Biology, Soochow University, Suzhou, China) ,  Shen Bairong (Institutes for Systems Genetics, Frontiers Science Center for Disease-related Molecular Network, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu 610041, China)
資料名： Journal of Biomedical Informatics  (Journal of Biomedical Informatics)
巻： 112  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： B0827A  ISSN： 1532-0464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 次世代配列決定技術の最新の進歩は,ゲノムとトランスクリプトミクスの広範な研究を大いに促進し,それによって,前例のない分解能で発癌の解読を促進する。癌分子機構の探索に対するハイスループットマルチオミクスデータ分析の寄与を考慮して,マルチオミクスデータ,すなわちトランスクリプトミクスプロファイル(mRNAまたはmiRNA発現データ)および蛋白質-DNA相互作用(ChIP-Seqデータ)のシステムレベル解釈のために,不均一マルチオミクスデータ解析(iODA)のための統合ツールを提案した。データ不均一性を考慮して,iODAは選択したサンプルデータのための差分解析における6つの統計的アルゴリズムを比較し,機能障害mRNAまたはmiRNA同定のためのグローバルに最適なものを選択する際にユーザを助けることができる。分子シグネチャは遺伝子レベルよりも経路レベルでより一貫性があるので,このツールはKEGG経路に同定された機能障害分子を濃縮でき,さらなる病因調査のための重要成分として一貫した項目を抽出した。他のツールと比較して,iODAは種々のレベルのオミクスデータを系統的に分析するための多機能であり,その分析力は単一および交差レベルの前立腺癌オミクスデータの事例研究を通して実証され,iODAはGNU GPL下のオープンソースであり,http://www.sysbio.org.cn/iODAからダウンロードできる。Copyright 2020 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  相互作用 ,  DNA【核酸】 ,  *mRNA ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  発癌 ,  事例研究 ,  前立腺腫瘍 ,  病因
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  トランスクリプトーム解析 ,  分子機構 ,  オープンソース ,  *オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 次世代シークエンシング ,  オミックスデータ ,  統計的アルゴリズム ,  統合解析 ,  経路

分類 (2件)： 医用情報処理  (JE15030Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： マルチオミクス ,  癌 ,  経路 ,  解析 ,  統合 ,  ツール