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J-GLOBAL ID：202002273047935318   整理番号：20A1038840

肝臓の栄養ストレスに応答したリボソーム滞留時間とアミノアシルtRNAのロバストな景観【JST・京大機械翻訳】

Robust landscapes of ribosome dwell times and aminoacyl-tRNAs in response to nutrient stress in liver

著者 (9件)： Gobet Cedric (Institute of Bioengineering, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne CH-1015, Switzerland) ,  Gobet Cedric (Nestle Research, CH-1015 Lausanne, Switzerland) ,  Weger Benjamin Dieter (Institute of Bioengineering, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne CH-1015, Switzerland) ,  Weger Benjamin Dieter (Nestle Research, CH-1015 Lausanne, Switzerland) ,  Marquis Julien (Nestle Research, CH-1015 Lausanne, Switzerland) ,  Martin Eva (Nestle Research, CH-1015 Lausanne, Switzerland) ,  Neelagandan Nagammal (Institute of Bioengineering, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne CH-1015, Switzerland) ,  Gachon Frederic (Nestle Research, CH-1015 Lausanne, Switzerland) ,  Naef Felix (Institute of Bioengineering, School of Life Sciences, Ecole Polytechnique Federale de Lausanne, Lausanne CH-1015, Switzerland)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 117  号： 17  ページ： 9630-9641  発行年： 2020年 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 翻訳はメッセンジャーRNA(mRNA)特異的開始,伸長及び停止速度に依存する。翻訳伸長は細菌と酵母で良く研究されているが,高等真核生物ではあまり知られていない。ここでは,リボソームおよび転写RNA(tRNA)プロファイリングを組み合わせて,哺乳類における翻訳伸長速度,(アミノアシル)tRNAレベルおよびコドン使用の間の関係を検討した。リボソーム部位間のコドン対相互作用を考慮して,リボソームプロファイリングからコドン特異的リボソーム滞留時間をモデル化した。マウス肝臓において,モデルは酵母のそれらと異なる部位及びコドン特異的滞留時間を明らかにし,P及びA部位の隣接コドンの対と同様に伸長を著しく減速又はスピードアップした。一方,翻訳効率は昼間の時間と摂食計画を通して変化するが,コドン滞留時間は非常に安定で,ヒトにおいて保存されていた。測定されたtRNAレベルはコドン使用と相関し,いくつかのtRNAは減少したアミノアシル化を示し,それは絶食マウスで保存された。最後に,最も長いコドン滞留時間は,tRNA量に対するアミノアシル化レベルまたは高いコドン使用により説明できることを明らかにした。Copyright 2020 The Author(s). Published by PNAS. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  *RNA【核酸】 ,  mRNA ,  *tRNA ,  酵母 ,  コドン ,  絶食 ,  タンパク質合成 ,  ヒト ,  哺乳類 ,  *アミノアシルtRNA ,  *リボソーム ,  真核生物 ,  *ロバスト性 ,  アミノアシル化

著者キーワード (4件)： 蛋白質合成 ,  リボソームプロファイリング ,  tRNA ,  計算生物学

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： 肝臓 ,  栄養ストレス ,  応答 ,  リボソーム ,  滞留時間 ,  アミノアシルtRNA ,  ロバスト ,  景観