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J-GLOBAL ID：202002273498999175   整理番号：20A0664640

教師つきおよびまばらな機能的ゲノム経路の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of supervised and sparse functional genomic pathways

著者 (4件)： Zhang Fan (Department of Biostatistics, SUNY University at Buffalo, Buffalo NY 14214, USA) ,  Miecznikowski Jeffrey C. (Department of Biostatistics, SUNY University at Buffalo, Buffalo NY, USA) ,  Tritchler David L. (Department of Biostatistics, SUNY University at Buffalo, Buffalo NY, USA) ,  Tritchler David L. (Division of Biostatistics, University of Toronto, Toronto, ON, Canada)
資料名： Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology  (Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology)
巻： 19  号： 1  ページ： 20180026  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3831A  ISSN： 2194-6302  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 機能的経路は,癌を含む多くの疾患の発生をもたらす一連の生物学的変化を含む。様々な「オミクス」技術の利用可能性により,生物学的層の階層から情報を統合し,病気に対するより包括的な理解を提供することが可能になる。多くの疾患において,サイズが比較的小さい少数のネットワークのみが疾患を駆動すると信じられている。本研究の目的は,表現型と相関した生物学的層を横切るこれらの機能的ネットワークを発見する方法を開発することである。最小二乗回帰関係に適合する潜在的経路を強調する新しいネットワーク要約行列(NSM)を導出した。不安定性正則化を用いたNSMの分解を含む不安定性(DNSMI)によるネットワーク要約行列の分解と呼ばれるアルゴリズムを提案した。このアルゴリズムの性能を実証するために,Cancer Genome Atlas(TCGA)プログラムからのシミュレーションと実データ解析を示した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データ解析 ,  最小二乗法 ,  不安定性 ,  表現型 ,  ネットワーク ,  アルゴリズム ,  正則化 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 不安定性 ,  経路解析 ,  まばら ,  教師付きネットワーク

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  オペレーションズリサーチ一般  (KA03010Q) ,  その他の情報処理  (JE15050M)

タイトルに関連する用語 (4件)： 教師 ,  ゲノム ,  経路 ,  同定