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J-GLOBAL ID：202002273543905214   整理番号：20A1557156

SLAF-seq技術に基づくシゾトラシン魚(コイ目:コイ科)のSSRマーカーのキャラクタリゼーションと開発【JST・京大機械翻訳】

Characterization and development of SSR markers of schizothoracine fish (Cypriniformes: Cyprinidae) based on SLAF-seq Technique

著者 (6件)： Li Xiaohui (Key Laboratory of Adaptation and Evolution of Plateau Biota, Qinghai Provincial Key Laboratory of Animal Ecological Genomics, Laboratory of Plateau Fish Evolutionary and Functional Genomics, Northwest Institute of Plateau Biology, Chinese Academy of Sciences, Xining, China) ,  Li Xiaohui (University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Tang Yongtao (Henan Normal University, Xinxiang, China) ,  Zhang Renyi (Guizhou Normal University, Guiyang, China) ,  Tian Fei (Key Laboratory of Adaptation and Evolution of Plateau Biota, Qinghai Provincial Key Laboratory of Animal Ecological Genomics, Laboratory of Plateau Fish Evolutionary and Functional Genomics, Northwest Institute of Plateau Biology, Chinese Academy of Sciences, Xining, China) ,  Zhao Kai (Key Laboratory of Adaptation and Evolution of Plateau Biota, Qinghai Provincial Key Laboratory of Animal Ecological Genomics, Laboratory of Plateau Fish Evolutionary and Functional Genomics, Northwest Institute of Plateau Biology, Chinese Academy of Sciences, Xining, China)
資料名： Journal of Applied Ichthyology  (Journal of Applied Ichthyology)
巻： 36  号： 4  ページ： 519-527  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1917A  ISSN： 0175-8659  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Schizothoracin魚類の高度に特殊化した等級は,主に青海-チベット高原とその周辺地域の排水に分布して,それは貴重な生物学資源を持った。しかし,過食および生息場所破壊は,HSGの遺伝資源および個体群遺伝構造に重大な影響を及ぼし,その野生資源を保護するための信頼できる遺伝子マーカーの探索が重要である。本研究では,27の新規多型マイクロサテライトをグレードのSLAFデータに基づいて全HSGに対して最初に発生させ,8種の4属からHSGにおける多型を評価した。W24,W41,W50は,低増幅効率の3~4集団のみに存在し,W3,W6,W12,W25,W28,およびW32の遺伝子座は,1~3種に存在せず,残りの18遺伝子座は,すべての標本で首尾よく増幅された。遺伝子座当たりの対立遺伝子数(NA)の平均は46.04で,12から79の範囲であり,平均観察と予想ヘテロ接合性は8種でそれぞれ0.539から0.785と0.471から0.669と推定された。各種の平均多型情報量(PIC)は0.669から0.433であった。平均Shannon-Weiner多様性指数(H’)の範囲は,8つの種において0.914から1.717まで計算した。要約するために,著者らはより高い品質と安定性を有する27のマイクロサテライト遺伝子座を開発し,それは,シゾラシン魚類の高度に特殊化したグレードの遺伝資源の研究のための有効な技術的支援を提供することができた。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 情報量 ,  対立遺伝子 ,  *コイ科 ,  生息場所 ,  キャラクタリゼーション ,  *コイ類 ,  遺伝資源 ,  マイクロサテライト
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  チベット高原 ,  ヘテロ接合性 ,  *マイクロサテライトマーカー ,  遺伝多様性 ,  マイクロサテライト遺伝子座 ,  個体群遺伝構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 遺伝的多様性 ,  シゾトラシン魚 ,  SLAF-seq技術 ,  SSR

分類 (1件)： 魚類  (FH02020K)

タイトルに関連する用語 (5件)： コイ目 ,  コイ科 ,  SSRマーカー ,  キャラクタリゼーション ,  開発