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J-GLOBAL ID：202002274137881517   整理番号：20A1034140

Smart2:反復によるマルチライブラリー統計的ミトゲノム集合【JST・京大機械翻訳】

SMART2: Multi-library Statistical Mitogenome Assembly with Repeats

著者 (3件)： Alqahtani Fahad (Computer Science and Engineering Department, University of Connecticut, Mansfield, CT, USA) ,  Alqahtani Fahad (National Center for Artificial Intelligence and Big Data Technology, King Abdulaziz City for Science and Technology, Riyadh, Saudi Arabia) ,  Mandoiu Ion (Computer Science and Engineering Department, University of Connecticut, Mansfield, CT, USA)
資料名： Lecture Notes in Computer Science  (Lecture Notes in Computer Science)
巻： 12029  ページ： 184-198  発行年： 2020年 
JST資料番号： H0078D  ISSN： 0302-9743  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： SMART2は低被覆全ゲノム配列決定(WGS)データからミトゲノム集合に対するSMARTパイプラインの改良版である。新しい特徴は,組立のために使用される読み取り対の最適数の自動選択と,利用可能な場合に複数の配列ライブラリを組み立てる能力を含む。SMART2は,WGSデータを有する26の後生動物種に対するミトコンドリア配列の生成に成功したが,NCBIデータベースにおける以前に発表されたミトゲノムはなかった。SMART2パイプラインは,ユーザに優しいGalaxyインタフェイスを介して公開されている。Copyright Springer Nature Switzerland AG 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  被覆 ,  ミトコンドリア ,  *ゲノム ,  インタフェイス
準シソーラス用語： 後生動物 ,  SMART ,  ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： ミトゲノム集合 ,  マルチライブラリ組立 ,  低カバレージ順序付け

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 反復 ,  マルチ ,  ライブラリー ,  統計 ,  ゲノム ,  集合